38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1995 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1995  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.89132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2389  hypothetical protein  92.75 
 
 		 262 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3306  hypothetical protein  92.75 
 
 		 262 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  0.0803287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1901  hypothetical protein  83.21 
 
 		 260 aa  460  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.490631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1884  hypothetical protein  48.42 
 
 		 254 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1088  hypothetical protein  35.1 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2102  hypothetical protein  37.22 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0811707  normal  0.0958552 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3207  Protein of unknown function YqcI/YcgG  32.91 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3074  hypothetical protein  35.35 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2127  hypothetical protein  31.6 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.728434  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1721  hypothetical protein  29.46 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.448514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1518  hypothetical protein  28.63 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3677  hypothetical protein  29.46 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1698  hypothetical protein  27.11 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1485  hypothetical protein  27.11 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0359471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1772  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.725111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1667  hypothetical protein  28.51 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1475  hypothetical protein  26.67 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.475847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1513  hypothetical protein  28.19 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.414599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1630  hypothetical protein  28.19 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3147  hypothetical protein  24.49 
 
 		 252 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.448031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1717  hypothetical protein  26.21 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2904  hypothetical protein  25.43 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.832854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3123  hypothetical protein  25.43 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2831  hypothetical protein  25.1 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0872  hypothetical protein  28.12 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2874  hypothetical protein  24.49 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00120897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3125  hypothetical protein  24.49 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0002  hypothetical protein  26.73 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5822  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464349  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3044  hypothetical protein  24.57 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01231  hypothetical protein  25.62 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.959365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0917  hypothetical protein  23.42 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2379  hypothetical protein  24.32 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3248  hypothetical protein  22.94 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2464  hypothetical protein  22.7 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2686  hypothetical protein  22.16 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2451  hypothetical protein  31.19 
 
 		 232 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00669633  normal  0.0444045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>