33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2102 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2102  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  583  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0811707  normal  0.0958552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3074  hypothetical protein  59.62 
 
 
265 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3207  Protein of unknown function YqcI/YcgG  59.77 
 
 
265 aa  326  3e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2127  hypothetical protein  60.08 
 
 
274 aa  321  7e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.728434  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1721  hypothetical protein  33.2 
 
 
242 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.448514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1772  hypothetical protein  32.79 
 
 
242 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.725111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1698  hypothetical protein  31.97 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1518  hypothetical protein  31.69 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1475  hypothetical protein  31.97 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.475847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1513  hypothetical protein  31.56 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.414599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1630  hypothetical protein  31.56 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1485  hypothetical protein  31.97 
 
 
242 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0359471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1667  hypothetical protein  31.97 
 
 
242 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3677  hypothetical protein  31.56 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0002  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0872  hypothetical protein  30.86 
 
 
247 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1995  hypothetical protein  37.22 
 
 
262 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.89132  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5822  hypothetical protein  31.7 
 
 
251 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464349  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2874  hypothetical protein  29.39 
 
 
252 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00120897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3125  hypothetical protein  29.88 
 
 
252 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3147  hypothetical protein  28.98 
 
 
252 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.448031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1088  hypothetical protein  29.49 
 
 
246 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2831  hypothetical protein  28.98 
 
 
252 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1901  hypothetical protein  31.8 
 
 
260 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.490631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1717  hypothetical protein  27.87 
 
 
252 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3123  hypothetical protein  28.57 
 
 
252 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2904  hypothetical protein  28.57 
 
 
252 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.832854  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3306  hypothetical protein  34.67 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  0.0803287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2389  hypothetical protein  34.67 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1884  hypothetical protein  31.35 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732059  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3248  hypothetical protein  28.25 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0164  hypothetical protein  25.58 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1830  hypothetical protein  26.79 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>