38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5822 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5822  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464349  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0872  hypothetical protein  54.74 
 
 
247 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2904  hypothetical protein  35.6 
 
 
252 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.832854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3123  hypothetical protein  35.6 
 
 
252 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3147  hypothetical protein  35.6 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.448031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1717  hypothetical protein  39.24 
 
 
252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2831  hypothetical protein  36.8 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3125  hypothetical protein  35.34 
 
 
252 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2874  hypothetical protein  34.94 
 
 
252 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00120897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3677  hypothetical protein  35.1 
 
 
242 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1721  hypothetical protein  33.88 
 
 
242 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.448514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1513  hypothetical protein  33.61 
 
 
242 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.414599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1630  hypothetical protein  33.61 
 
 
242 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1667  hypothetical protein  35.37 
 
 
242 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1518  hypothetical protein  32.1 
 
 
242 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1698  hypothetical protein  33.2 
 
 
242 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1485  hypothetical protein  33.2 
 
 
242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0359471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1475  hypothetical protein  33.2 
 
 
242 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.475847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1772  hypothetical protein  32.79 
 
 
242 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.725111  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2127  hypothetical protein  33.9 
 
 
274 aa  116  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.728434  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0002  hypothetical protein  36.18 
 
 
249 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2102  hypothetical protein  31.7 
 
 
290 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0811707  normal  0.0958552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3074  hypothetical protein  31.49 
 
 
265 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3207  Protein of unknown function YqcI/YcgG  34.47 
 
 
265 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1088  hypothetical protein  23.79 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2389  hypothetical protein  27.35 
 
 
262 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3306  hypothetical protein  27.35 
 
 
262 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  0.0803287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1884  hypothetical protein  26.32 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1995  hypothetical protein  28.1 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.89132  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1901  hypothetical protein  26.57 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.490631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4911  hypothetical protein  25.11 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3044  hypothetical protein  25.96 
 
 
246 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2566  hypothetical protein  27.4 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0265938  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1830  hypothetical protein  25.77 
 
 
250 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2379  hypothetical protein  23.11 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0164  hypothetical protein  25.65 
 
 
234 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2464  hypothetical protein  23.11 
 
 
251 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2686  hypothetical protein  23.11 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.981646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>