35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3306 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2389  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3306  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  0.0803287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1995  hypothetical protein  92.75 
 
 		 262 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.89132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1901  hypothetical protein  85.11 
 
 		 260 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.490631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1884  hypothetical protein  50.23 
 
 		 254 aa  241  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1088  hypothetical protein  36.54 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2102  hypothetical protein  34.67 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0811707  normal  0.0958552 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3207  Protein of unknown function YqcI/YcgG  32.81 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1721  hypothetical protein  29.86 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.448514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3074  hypothetical protein  34.11 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1518  hypothetical protein  29.15 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2127  hypothetical protein  31.11 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.728434  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3677  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1698  hypothetical protein  28.51 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1485  hypothetical protein  28.51 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0359471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1772  hypothetical protein  28.96 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.725111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1475  hypothetical protein  28.05 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.475847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1667  hypothetical protein  28.05 
 
 		 242 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1630  hypothetical protein  28.12 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1513  hypothetical protein  28.12 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.414599  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0872  hypothetical protein  30.14 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1717  hypothetical protein  27.62 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2904  hypothetical protein  25.32 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.832854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3123  hypothetical protein  25.32 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2831  hypothetical protein  25.1 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3147  hypothetical protein  23.67 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.448031  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0002  hypothetical protein  29.49 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5822  hypothetical protein  27.78 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464349  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2874  hypothetical protein  24.03 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00120897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3125  hypothetical protein  24.03 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3044  hypothetical protein  24.43 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2379  hypothetical protein  24.86 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0917  hypothetical protein  21.93 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01231  hypothetical protein  24.32 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.959365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2451  hypothetical protein  30.63 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00669633  normal  0.0444045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>