24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3044 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3044  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0164  hypothetical protein  55.76 
 
 		 234 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1618  hypothetical protein  58.14 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1830  hypothetical protein  58.6 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4911  hypothetical protein  55.45 
 
 		 251 aa  234  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2686  hypothetical protein  54.79 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2464  hypothetical protein  54.34 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2379  hypothetical protein  55.91 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2566  hypothetical protein  55.76 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0265938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3248  hypothetical protein  50.72 
 
 		 218 aa  231  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01231  hypothetical protein  43.28 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.959365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0917  hypothetical protein  39.9 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3123  hypothetical protein  25.46 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2904  hypothetical protein  25.46 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.832854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2831  hypothetical protein  25.12 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1901  hypothetical protein  25.78 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.490631 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3125  hypothetical protein  24.65 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3147  hypothetical protein  24.64 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.448031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1995  hypothetical protein  23.08 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.89132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5822  hypothetical protein  25.96 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464349  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2874  hypothetical protein  24.19 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00120897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1884  hypothetical protein  26.46 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3306  hypothetical protein  23.08 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  0.0803287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2389  hypothetical protein  23.08 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>