29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0917 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0917  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2379  hypothetical protein  47.6 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2686  hypothetical protein  47.55 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2464  hypothetical protein  47.55 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0164  hypothetical protein  46.41 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01231  hypothetical protein  43.9 
 
 		 209 aa  195  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.959365  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3248  hypothetical protein  43.35 
 
 		 218 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4911  hypothetical protein  44.12 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1830  hypothetical protein  43.19 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2566  hypothetical protein  43 
 
 		 255 aa  181  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0265938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1618  hypothetical protein  45.33 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3044  hypothetical protein  39.9 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3207  Protein of unknown function YqcI/YcgG  29.95 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2127  hypothetical protein  27.98 
 
 		 274 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.728434  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3074  hypothetical protein  26.98 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1630  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1513  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.414599  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1475  hypothetical protein  24.54 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.475847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1485  hypothetical protein  24.54 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0359471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1667  hypothetical protein  23.72 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1698  hypothetical protein  24.54 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1518  hypothetical protein  24.07 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1772  hypothetical protein  23.74 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.725111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1721  hypothetical protein  24.41 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.448514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3147  hypothetical protein  23.7 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.448031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2831  hypothetical protein  22.75 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3677  hypothetical protein  24.07 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1901  hypothetical protein  21.82 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.490631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0002  hypothetical protein  28.19 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>