33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01231 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01231  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.959365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4911  hypothetical protein  44.72 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0164  hypothetical protein  46.31 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2379  hypothetical protein  44.72 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2464  hypothetical protein  45.18 
 
 		 251 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2686  hypothetical protein  45.18 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0917  hypothetical protein  43.9 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3044  hypothetical protein  43.28 
 
 		 246 aa  190  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1830  hypothetical protein  44.33 
 
 		 250 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3248  hypothetical protein  42.71 
 
 		 218 aa  188  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1618  hypothetical protein  46.53 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2566  hypothetical protein  43.22 
 
 		 255 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0265938  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2904  hypothetical protein  25.12 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.832854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3123  hypothetical protein  25.12 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3147  hypothetical protein  23.47 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.448031  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1901  hypothetical protein  25.73 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.490631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3074  hypothetical protein  27.43 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3207  Protein of unknown function YqcI/YcgG  28.14 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0002  hypothetical protein  23.81 
 
 		 249 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1884  hypothetical protein  26.25 
 
 		 254 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1995  hypothetical protein  25.62 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.89132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1772  hypothetical protein  24.26 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.725111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1475  hypothetical protein  23.66 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.475847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1485  hypothetical protein  23.66 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0359471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1721  hypothetical protein  24.26 
 
 		 242 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.448514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1698  hypothetical protein  23.66 
 
 		 242 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1630  hypothetical protein  24.26 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1513  hypothetical protein  24.26 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.414599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3306  hypothetical protein  24.79 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  0.0803287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2389  hypothetical protein  24.79 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1518  hypothetical protein  24.26 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1667  hypothetical protein  23.78 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1717  hypothetical protein  23.12 
 
 		 252 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>