33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2379 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2379  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2464  hypothetical protein  92.83 
 
 
251 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2686  hypothetical protein  92.43 
 
 
251 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4911  hypothetical protein  75.6 
 
 
251 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2566  hypothetical protein  66.67 
 
 
255 aa  328  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0265938  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1830  hypothetical protein  69.2 
 
 
250 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0164  hypothetical protein  64.91 
 
 
234 aa  298  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1618  hypothetical protein  63.98 
 
 
222 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3044  hypothetical protein  55.91 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3248  hypothetical protein  50.47 
 
 
218 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0917  hypothetical protein  47.6 
 
 
222 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01231  hypothetical protein  44.72 
 
 
209 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.959365  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3207  Protein of unknown function YqcI/YcgG  28.81 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3074  hypothetical protein  28.24 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2127  hypothetical protein  29.55 
 
 
274 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.728434  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1518  hypothetical protein  24.09 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1667  hypothetical protein  25 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5822  hypothetical protein  23.11 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464349  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1485  hypothetical protein  24.22 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0359471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1721  hypothetical protein  24.03 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.448514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3123  hypothetical protein  22.79 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1772  hypothetical protein  23.71 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.725111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1475  hypothetical protein  24.03 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.475847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1698  hypothetical protein  24.22 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2904  hypothetical protein  22.79 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.832854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1901  hypothetical protein  24.74 
 
 
260 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.490631 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1630  hypothetical protein  24.22 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1513  hypothetical protein  24.22 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.414599  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2389  hypothetical protein  24.84 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3306  hypothetical protein  24.84 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal  0.0803287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1995  hypothetical protein  24.2 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.89132  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3147  hypothetical protein  21.4 
 
 
252 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.448031  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0872  hypothetical protein  21.98 
 
 
247 aa  42  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>