25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2464 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2686  hypothetical protein  99.6 
 
 		 251 aa  510  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2464  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2379  hypothetical protein  92.83 
 
 		 251 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4911  hypothetical protein  75.2 
 
 		 251 aa  394  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2566  hypothetical protein  65.45 
 
 		 255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0265938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1830  hypothetical protein  68.64 
 
 		 250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0164  hypothetical protein  64.71 
 
 		 234 aa  291  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1618  hypothetical protein  62.26 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3044  hypothetical protein  54.34 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3248  hypothetical protein  51.4 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0917  hypothetical protein  47.55 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01231  hypothetical protein  45.18 
 
 		 209 aa  195  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.959365  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3207  Protein of unknown function YqcI/YcgG  27.47 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1518  hypothetical protein  24.31 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3123  hypothetical protein  23.61 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2904  hypothetical protein  23.61 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.832854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5822  hypothetical protein  23.11 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464349  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1485  hypothetical protein  23.64 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0359471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3147  hypothetical protein  22.22 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.448031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1698  hypothetical protein  23.64 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1630  hypothetical protein  23.64 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2831  hypothetical protein  22.22 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1513  hypothetical protein  23.64 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.414599  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3074  hypothetical protein  25.74 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0872  hypothetical protein  23.5 
 
 		 247 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>