More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1232 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1323  DnaK like protein  85.16 
 
 
539 aa  950    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1232  DnaK like protein  100 
 
 
539 aa  1098    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.411227  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2261  DnaK like protein  90.17 
 
 
539 aa  1004    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1029  DnaK like protein  90.54 
 
 
539 aa  1001    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0572  heat shock protein Hsp70  28.21 
 
 
532 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0523  heat shock protein 70  28.65 
 
 
531 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.051557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0893  heat shock protein 70  27.68 
 
 
530 aa  183  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4193  Heat shock protein 70  28.65 
 
 
531 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.4736  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4153  Heat shock protein 70  28.65 
 
 
531 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3847  Heat shock protein 70  29.44 
 
 
532 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0171  Heat shock protein 70  27.93 
 
 
531 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4102  Heat shock protein 70  29.73 
 
 
520 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2443  Heat shock protein 70  28.89 
 
 
520 aa  173  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938379  hitchhiker  0.000000172918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0111  DnaK protein-like  28.99 
 
 
531 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0754915  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5280  Heat shock protein 70  29.91 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.465125  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05101  HSP70 family molecular chaperone  25.93 
 
 
541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2115  molecular chaperone DnaK  26.5 
 
 
618 aa  117  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0501961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0238  chaperone protein DnaK  25.42 
 
 
617 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18321  HSP70 family molecular chaperone  25.37 
 
 
541 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0462  molecular chaperone DnaK  25.95 
 
 
622 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0589911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0449  molecular chaperone DnaK  25.95 
 
 
622 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0473  molecular chaperone DnaK  25.95 
 
 
622 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518143  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0196  molecular chaperone DnaK  25.23 
 
 
613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  26.85 
 
 
607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0964  molecular chaperone DnaK  25.25 
 
 
541 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.861291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0634  molecular chaperone DnaK  25.45 
 
 
622 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0260  molecular chaperone DnaK  25.59 
 
 
622 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0242137  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1452  molecular chaperone DnaK  25.54 
 
 
498 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0529  class I heat-shock protein (chaperonin)  24.86 
 
 
623 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  25.41 
 
 
608 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4807  chaperone protein DnaK  25.59 
 
 
627 aa  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0128  chaperone DnaK  24.36 
 
 
610 aa  107  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.438221  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15501  HSP70 family molecular chaperone  24.12 
 
 
522 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00346442  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0870  heat shock protein Hsp70  25.88 
 
 
638 aa  107  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100089  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1348  chaperone protein DnaK  23.49 
 
 
614 aa  106  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5471  chaperone protein DnaK  24.21 
 
 
616 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10355  molecular chaperone DnaK  25.59 
 
 
625 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38580  molecular chaperone DnaK  25.36 
 
 
619 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0889  molecular chaperone DnaK  25.58 
 
 
617 aa  104  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0486  chaperone protein DnaK  25.09 
 
 
613 aa  104  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2079  molecular chaperone DnaK  24.8 
 
 
612 aa  104  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4363  chaperone protein DnaK  25.18 
 
 
621 aa  104  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.62994  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1358  chaperone protein DnaK  25.43 
 
 
602 aa  103  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1358  chaperone protein DnaK  23.83 
 
 
626 aa  103  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00416973  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4352  molecular chaperone DnaK  24.31 
 
 
616 aa  103  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1166  chaperone protein DnaK  23.95 
 
 
605 aa  103  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0346  molecular chaperone DnaK  24.82 
 
 
600 aa  102  1e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.000727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0517  HSP70 family molecular chaperone  25.87 
 
 
524 aa  103  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0607  chaperone protein DnaK  26.01 
 
 
605 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0247  chaperone protein DnaK  24.54 
 
 
621 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0982  molecular chaperone DnaK  25.09 
 
 
644 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000339197  unclonable  0.0000180058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6949  molecular chaperone DnaK  25.5 
 
 
619 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1128  molecular chaperone DnaK  24.39 
 
 
596 aa  103  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5218  chaperone protein DnaK  24.63 
 
 
616 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0233  molecular chaperone DnaK  24.13 
 
 
612 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0850  molecular chaperone DnaK  23.47 
 
 
623 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4195  molecular chaperone DnaK  24.6 
 
 
638 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.697831  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16221  HSP70 family molecular chaperone  23.74 
 
 
522 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.477832  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2013  chaperone protein DnaK  26.08 
 
 
636 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4693  molecular chaperone DnaK  26.38 
 
 
643 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0775  molecular chaperone DnaK  23.65 
 
 
623 aa  102  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.175007  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1258  molecular chaperone DnaK  23.29 
 
 
623 aa  101  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.757771  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0622  chaperone protein DnaK  23.3 
 
 
600 aa  100  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0182249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4270  chaperone protein DnaK  26.09 
 
 
613 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0765  chaperone protein DnaK  25.06 
 
 
607 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.752703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0013  molecular chaperone DnaK  25.45 
 
 
638 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0013  molecular chaperone DnaK  25.45 
 
 
638 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.767779  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4180  molecular chaperone DnaK  25.53 
 
 
723 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0013  molecular chaperone DnaK  25.45 
 
 
638 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.693638  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0013  molecular chaperone DnaK  25.45 
 
 
638 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0012  molecular chaperone DnaK  25.45 
 
 
638 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.276722  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0581  molecular chaperone DnaK  25.05 
 
 
639 aa  100  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3624  molecular chaperone DnaK  24.2 
 
 
637 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2132  molecular chaperone DnaK  27.08 
 
 
647 aa  99.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0108492  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0935  molecular chaperone DnaK  23.53 
 
 
622 aa  99.4  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.550928  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2456  molecular chaperone DnaK  27.08 
 
 
647 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00641905  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0096  chaperone protein DnaK  24.3 
 
 
636 aa  99  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0207175 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1960  chaperone protein DnaK  26.79 
 
 
613 aa  98.6  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.638258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  24.01 
 
 
621 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0544  molecular chaperone DnaK  25.22 
 
 
596 aa  99  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2046  molecular chaperone DnaK  23.83 
 
 
623 aa  98.6  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000592664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0692  molecular chaperone DnaK  25.05 
 
 
637 aa  99.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00232011  hitchhiker  0.00343274 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0558  molecular chaperone DnaK  25.22 
 
 
596 aa  99  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000712029  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0148  molecular chaperone DnaK  23.42 
 
 
625 aa  97.8  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0238648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3094  chaperone DnaK  24.06 
 
 
644 aa  97.8  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0408879  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  24.22 
 
 
644 aa  97.8  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3362  molecular chaperone DnaK  24.47 
 
 
641 aa  98.2  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00483084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4793  chaperone protein DnaK  27.22 
 
 
637 aa  97.8  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126797  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1148  molecular chaperone DnaK  24.86 
 
 
609 aa  97.8  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2464  molecular chaperone DnaK  23.9 
 
 
651 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0705  molecular chaperone DnaK  24.2 
 
 
642 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.991542  hitchhiker  0.00373159 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2076  molecular chaperone DnaK  24.11 
 
 
629 aa  97.4  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000834222  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1403  molecular chaperone DnaK  26.23 
 
 
625 aa  97.4  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000203004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1600  molecular chaperone DnaK  23.9 
 
 
641 aa  97.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.56491  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0542  molecular chaperone DnaK  25.05 
 
 
636 aa  97.4  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3808  molecular chaperone DnaK  25.09 
 
 
622 aa  97.4  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4505  dnaK protein  23.62 
 
 
638 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.493452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0797  molecular chaperone DnaK  24.65 
 
 
636 aa  97.1  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000118812  normal  0.123842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2870  molecular chaperone DnaK  23.68 
 
 
650 aa  97.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2437  molecular chaperone DnaK  25.59 
 
 
609 aa  97.1  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0177515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>