299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0015 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_R0049  23S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 2911 bp  704    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.147813  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0020  23S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 2940 bp  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0054  23S ribosomal RNA  99.97 
 
 		 2902 bp  5745    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.439504  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0015  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2902 bp  5753    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.770252  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0015  23S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 2940 bp  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0028  23S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 2940 bp  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.973163  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0033  23S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 2940 bp  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0017  23S ribosomal RNA  85.22 
 
 		 3993 bp  704    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0503032  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0027  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 3023 bp  450  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.26037  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0027  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 3718 bp  450  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0041  23S ribosomal RNA  80.39 
 
 		 3027 bp  379  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0513089  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0025  23S ribosomal RNA  80.39 
 
 		 3027 bp  379  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2946 bp  363  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2943 bp  363  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 2944 bp  355  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 2946 bp  355  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 2944 bp  355  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  85.01 
 
 		 2946 bp  355  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0047  23S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 2866 bp  337  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0050  23S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 2866 bp  337  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0019  23S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 2866 bp  337  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0048  23S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 2866 bp  337  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 2972 bp  337  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrlVIMSS1365779  23S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 2875 bp  337  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.069762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0005  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2878 bp  329  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  normal  0.226788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0051  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2878 bp  329  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00795869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0003  23S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 3009 bp  327  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.168115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0029  23S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 3009 bp  327  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.795841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0008  23S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 3357 bp  325  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0017  23S ribosomal RNA  92.67 
 
 		 3592 bp  325  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0048  23S ribosomal RNA  92.67 
 
 		 3592 bp  325  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0032  23S ribosomal RNA  92.67 
 
 		 3592 bp  325  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.287543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0060  23S ribosomal RNA  92.67 
 
 		 3592 bp  325  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.129555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0051  23S ribosomal RNA  92.67 
 
 		 3592 bp  325  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0077  23S ribosomal RNA  92.67 
 
 		 3592 bp  325  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0379  23S ribosomal RNA  84.15 
 
 		 2894 bp  325  3.9999999999999996e-86  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0031  23S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 3357 bp  325  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0093  23S ribosomal RNA  92.67 
 
 		 3592 bp  325  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0004  23S ribosomal RNA  92.67 
 
 		 3592 bp  325  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0030  23S ribosomal RNA  85.57 
 
 		 2942 bp  323  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0025  23S ribosomal RNA  85.57 
 
 		 2942 bp  323  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0014  23S ribosomal RNA  85.57 
 
 		 2942 bp  323  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0013  23S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 2885 bp  321  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0039  23S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 2885 bp  321  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0027  23S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 2885 bp  321  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.877098 
 
 
-
 
NC_006055  Mflr02  23S ribosomal RNA  89.12 
 
 		 2736 bp  319  2.9999999999999996e-84  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr05  23S ribosomal RNA  89.12 
 
 		 2736 bp  319  2.9999999999999996e-84  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  89.12 
 
 		 3129 bp  319  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  89.12 
 
 		 3129 bp  319  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  89.12 
 
 		 3129 bp  319  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  89.12 
 
 		 3129 bp  319  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0019  23S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 2820 bp  317  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0050  23S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 2820 bp  317  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0060  23S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 2820 bp  317  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996715  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0073  23S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 2820 bp  317  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0081  23S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 2820 bp  317  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0084  23S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 2820 bp  317  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0832  23S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 2894 bp  317  1e-83  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0051  23S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 2818 bp  317  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0061  23S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 2818 bp  317  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0073  23S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 2818 bp  317  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0078  23S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 2818 bp  317  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2922 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2922 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2922 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2922 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2922 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2922 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0009  23S ribosomal RNA  86.29 
 
 		 2961 bp  313  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.609775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0080  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2923 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0064  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2923 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0069  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2923 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0069  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2923 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0064  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2923 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65244  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_R0066  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2885 bp  313  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0008  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2890 bp  313  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  decreased coverage  0.00656926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0043  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2890 bp  313  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363579  decreased coverage  0.0035918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0063  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2890 bp  313  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0080  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2923 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0018  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2923 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.193918  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0019  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2923 bp  313  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0085  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 2908 bp  311  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.24545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0098  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 2908 bp  311  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.417316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0004  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 2908 bp  311  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0093  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 2908 bp  311  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0033  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 2908 bp  311  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525204  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0022  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 2908 bp  311  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0015  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 		 2908 bp  311  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.924837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05738  23S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 2818 bp  309  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00792768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0061  23S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 2818 bp  309  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.167794  normal  0.58744 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03723  23S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 2892 bp  309  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_r07  23S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 2892 bp  309  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0045  23S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 2877 bp  309  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_r08  23S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 2892 bp  309  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0056  23S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 2877 bp  309  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.235733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_r05  23S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 2892 bp  309  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_r01  23S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 2892 bp  309  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0052  23S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 2818 bp  309  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.629541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrlVIMSS1365801  23S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 2876 bp  309  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.646586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_r02  23S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 2892 bp  309  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>