More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_R0009 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  Gs23SA  23S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 2958 bp  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 2958 bp  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  84.1 
 
 		 2909 bp  755    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2909 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2909 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2926 bp  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2851 bp  761    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-7  23S ribosomal RNA  82.95 
 
 		 2911 bp  753    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-9  23S ribosomal RNA  82.95 
 
 		 2911 bp  753    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2912 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2912 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2912 bp  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  82.97 
 
 		 2913 bp  747    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2911 bp  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2912 bp  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0049  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2956 bp  678    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0054  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 		 2956 bp  678    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  84.52 
 
 		 2983 bp  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 2983 bp  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 2908 bp  737    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 2908 bp  737    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 2908 bp  737    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  82.87 
 
 		 2908 bp  745    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SG  23S ribosomal RNA  82.95 
 
 		 2908 bp  753    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SI  23S ribosomal RNA  82.95 
 
 		 2908 bp  753    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000225912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 2908 bp  761    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 2908 bp  737    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 3129 bp  698    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 3129 bp  698    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  82.7 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 2908 bp  737    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 2908 bp  737    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0023  23S ribosomal RNA  84.92 
 
 		 3000 bp  912    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 2908 bp  737    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  82.87 
 
 		 2908 bp  745    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 2908 bp  777    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0045  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2984 bp  644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 2907 bp  777    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  83.12 
 
 		 2907 bp  769    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 2907 bp  777    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 2907 bp  777    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0018  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 		 2984 bp  644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.390452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 2907 bp  777    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 2908 bp  777    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 2908 bp  777    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  83.12 
 
 		 2907 bp  769    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 2908 bp  737    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 2907 bp  777    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 2907 bp  777    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  83.12 
 
 		 2908 bp  769    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 2907 bp  777    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0007  23S ribosomal RNA  83.37 
 
 		 2898 bp  646    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0012  23S ribosomal RNA  83.37 
 
 		 2898 bp  646    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  82.87 
 
 		 2908 bp  745    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 2908 bp  737    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 2908 bp  737    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>