More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0023 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  Gs23SA  23S ribosomal RNA  83.98 
 
 		 2958 bp  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  83.98 
 
 		 2958 bp  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2922 bp  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2922 bp  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2922 bp  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2922 bp  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2922 bp  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2922 bp  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0024  23S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 2556 bp  670    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0314547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 		 2907 bp  751    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2909 bp  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2909 bp  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2909 bp  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2926 bp  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0064  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2923 bp  662    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0030  23S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 2904 bp  646    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000445054  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0008  23S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 2904 bp  646    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0096662  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0021  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2923 bp  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0069  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2923 bp  662    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 2911 bp  712    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2851 bp  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-7  23S ribosomal RNA  83.86 
 
 		 2911 bp  700    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-9  23S ribosomal RNA  83.65 
 
 		 2911 bp  696    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2912 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2912 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2912 bp  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2913 bp  690    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2911 bp  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2912 bp  704    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0051  23S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 2556 bp  670    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0486976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0061  23S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 2556 bp  670    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0035  23S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 2556 bp  670    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.381491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0006  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2923 bp  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0018  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2923 bp  662    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.193918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0013  23S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 2913 bp  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0027  23S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 2913 bp  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0006  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2923 bp  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0022  23S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 2923 bp  654    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0064  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2923 bp  662    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0019  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2923 bp  662    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 		 2908 bp  751    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0080  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2923 bp  662    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0069  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2923 bp  662    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2983 bp  678    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2983 bp  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0012  23S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 2898 bp  710    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0007  23S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 2898 bp  710    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0023  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 3000 bp  5947    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 2897 bp  648    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SG  23S ribosomal RNA  83.86 
 
 		 2908 bp  700    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SI  23S ribosomal RNA  83.65 
 
 		 2908 bp  696    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000225912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  83.85 
 
 		 2908 bp  712    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  83.75 
 
 		 2908 bp  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0080  23S ribosomal RNA  83.17 
 
 		 2923 bp  662    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 2897 bp  648    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 2897 bp  648    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 2897 bp  648    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  84.43 
 
 		 2898 bp  648    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>