More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_R0008 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0021  23S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 2893 bp  737    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000272892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0053  23S ribosomal RNA  84.17 
 
 		 2893 bp  737    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00828042  normal  0.0734628 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_R0066  23S ribosomal RNA  99.69 
 
 		 2885 bp  5648    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0008  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2890 bp  5729    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.112108  decreased coverage  0.00656926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0043  23S ribosomal RNA  99.79 
 
 		 2890 bp  5681    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363579  decreased coverage  0.0035918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0063  23S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 2890 bp  5713    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2999  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2909 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3002  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3005  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3008  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3011  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3014  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3017  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3020  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2907 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r02  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r05  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r08  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r11  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r14  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r17  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r20  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r23  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2908 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r25  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2907 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r29  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 		 2907 bp  517  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0411  23S ribosomal RNA  86.6 
 
 		 2902 bp  513  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  86.93 
 
 		 2933 bp  513  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0004  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2928 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0170  23S ribosomal RNA  86.6 
 
 		 2902 bp  513  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0010  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  86.93 
 
 		 2935 bp  513  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0183  23S ribosomal RNA  86.6 
 
 		 2902 bp  513  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0081  23S ribosomal RNA  86.6 
 
 		 2902 bp  513  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  86.93 
 
 		 2933 bp  513  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  86.93 
 
 		 2933 bp  513  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  86.93 
 
 		 2933 bp  513  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  86.93 
 
 		 2933 bp  513  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  86.93 
 
 		 2933 bp  513  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  86.93 
 
 		 2933 bp  513  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  86.93 
 
 		 2932 bp  513  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  86.93 
 
 		 2933 bp  513  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0037  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1782  23S ribosomal RNA  86.6 
 
 		 2901 bp  513  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0021  23S ribosomal RNA  86.6 
 
 		 2902 bp  513  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2946 bp  509  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2944 bp  509  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SA  23S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 2903 bp  509  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SB  23S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 2903 bp  509  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SC  23S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 2903 bp  509  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SD  23S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 2903 bp  509  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.635021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SE  23S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 2903 bp  509  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.651063  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SF  23S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 2903 bp  509  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SG  23S ribosomal RNA  87.17 
 
 		 2903 bp  509  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2946 bp  509  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2944 bp  509  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2943 bp  509  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2946 bp  509  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0063  23S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 2924 bp  490  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00771367  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0025  23S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 2925 bp  490  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.610781  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0010  23S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 2925 bp  490  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0078  23S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 2925 bp  490  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0049  23S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 2925 bp  490  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0004  23S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 2925 bp  490  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545462  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0056  23S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 2881 bp  476  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.040674  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0006  23S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 2881 bp  476  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0316316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  86.3 
 
 		 3129 bp  476  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  86.3 
 
 		 3129 bp  476  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  86.3 
 
 		 3129 bp  476  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  86.3 
 
 		 3129 bp  476  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  83.4 
 
 		 2983 bp  474  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0062  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2972 bp  472  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0032  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2972 bp  472  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.922889  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0059  23S ribosomal RNA  86.31 
 
 		 2972 bp  472  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0139247  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1619  23S ribosomal RNA  86.39 
 
 		 2631 bp  470  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.20169 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1565  23S ribosomal RNA  86.39 
 
 		 2631 bp  470  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1584  23S ribosomal RNA  86.39 
 
 		 2631 bp  470  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0450  23S ribosomal RNA  86.39 
 
 		 2632 bp  470  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.226128 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0054  23S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 2969 bp  466  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 2922 bp  466  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 2922 bp  466  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 2922 bp  466  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 2922 bp  466  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 2922 bp  466  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0019  23S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 2923 bp  466  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0069  23S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 2923 bp  466  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0070  23S ribosomal RNA  81.69 
 
 		 2954 bp  466  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0069  23S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 2923 bp  466  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 2909 bp  466  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0035  23S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 2969 bp  466  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0006  23S ribosomal RNA  88.91 
 
 		 2969 bp  466  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0080  23S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 2923 bp  466  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0021  23S ribosomal RNA  81.69 
 
 		 2954 bp  466  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0060  23S ribosomal RNA  81.69 
 
 		 2954 bp  466  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0055  23S ribosomal RNA  81.69 
 
 		 2954 bp  466  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0080  23S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 2923 bp  466  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0064  23S ribosomal RNA  85.54 
 
 		 2923 bp  466  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>