More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0379 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  Gs23SA  23S ribosomal RNA  84.52 
 
 		 2958 bp  753    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  84.52 
 
 		 2958 bp  753    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1804  23S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 2631 bp  704    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000784168 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1798  23S ribosomal RNA  83.38 
 
 		 2631 bp  704    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.25169e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0061  23S ribosomal RNA  83.43 
 
 		 2556 bp  666    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0051  23S ribosomal RNA  83.43 
 
 		 2556 bp  666    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0486976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0035  23S ribosomal RNA  83.43 
 
 		 2556 bp  666    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.381491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0024  23S ribosomal RNA  83.43 
 
 		 2556 bp  666    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0314547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0020  23S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 3062 bp  642    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000158535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  84.73 
 
 		 2935 bp  698    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0036  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2850 bp  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0024  23S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 2847 bp  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00320172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  83.77 
 
 		 2933 bp  700    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0071  23S ribosomal RNA  82.73 
 
 		 2912 bp  650    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.19372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0055  23S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 2954 bp  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  82.71 
 
 		 3088 bp  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  82.71 
 
 		 3529 bp  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0060  23S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 2954 bp  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0045  23S ribosomal RNA  83.37 
 
 		 2984 bp  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0071  23S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 2850 bp  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.764689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0031  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2850 bp  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0018  23S ribosomal RNA  83.37 
 
 		 2984 bp  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.390452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0009  23S ribosomal RNA  82.73 
 
 		 2912 bp  650    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.363949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  83.77 
 
 		 2933 bp  700    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0070  23S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 2954 bp  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0063  23S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 2976 bp  656    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0036  23S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 2934 bp  656    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 2927 bp  733    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 2927 bp  733    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr02  23S ribosomal RNA  91.08 
 
 		 2736 bp  3418    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr05  23S ribosomal RNA  91.08 
 
 		 2736 bp  3418    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R06  23S ribosomal RNA  86.73 
 
 		 2733 bp  854    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0008  23S ribosomal RNA  83.56 
 
 		 2847 bp  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0021  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 2850 bp  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.335485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  84.52 
 
 		 2983 bp  753    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  84.42 
 
 		 2983 bp  745    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0079  23S ribosomal RNA  82.73 
 
 		 2913 bp  650    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0064  23S ribosomal RNA  82.64 
 
 		 2912 bp  642    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00853635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  83.77 
 
 		 2933 bp  700    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  84.73 
 
 		 2933 bp  698    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  83.77 
 
 		 2933 bp  700    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0021  23S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 2954 bp  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 2933 bp  716    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0379  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2894 bp  5737    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0832  23S ribosomal RNA  99.86 
 
 		 2894 bp  5705    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1584  23S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 2631 bp  696    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0021  23S ribosomal RNA  82.62 
 
 		 3260 bp  668    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1619  23S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 2631 bp  696    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.20169 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1565  23S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 2631 bp  696    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0450  23S ribosomal RNA  83.29 
 
 		 2632 bp  696    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.226128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0004  23S ribosomal RNA  84.09 
 
 		 2928 bp  733    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 2927 bp  741    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 2927 bp  741    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0068  23S ribosomal RNA  83.43 
 
 		 2935 bp  632  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.502369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0049  23S ribosomal RNA  82.95 
 
 		 2956 bp  620  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0054  23S ribosomal RNA  82.95 
 
 		 2956 bp  620  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175608  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r02  23S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 2908 bp  617  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0074  23S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 2609 bp  615  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00146818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0014  23S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 2609 bp  615  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.609994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  88.56 
 
 		 2933 bp  611  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  88.56 
 
 		 2933 bp  611  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  88.56 
 
 		 2909 bp  611  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  88.56 
 
 		 2932 bp  611  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r17  23S ribosomal RNA  82.6 
 
 		 2908 bp  609  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0051  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 3592 bp  607  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0077  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 3592 bp  607  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0032  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 3592 bp  607  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.287543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0004  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 3592 bp  607  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0093  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 3592 bp  607  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0060  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 3592 bp  607  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.129555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0017  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 3592 bp  607  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0048  23S ribosomal RNA  83.55 
 
 		 3592 bp  607  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3002  23S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 2908 bp  609  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2908 bp  603  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2909 bp  603  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2909 bp  603  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2908 bp  603  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r29  23S ribosomal RNA  82.7 
 
 		 2907 bp  603  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r25  23S ribosomal RNA  82.38 
 
 		 2907 bp  601  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2912 bp  603  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  88.38 
 
 		 2911 bp  603  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3014  23S ribosomal RNA  82.7 
 
 		 2908 bp  603  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3017  23S ribosomal RNA  82.7 
 
 		 2908 bp  603  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3020  23S ribosomal RNA  82.7 
 
 		 2907 bp  603  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r05  23S ribosomal RNA  82.7 
 
 		 2908 bp  603  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r08  23S ribosomal RNA  82.7 
 
 		 2908 bp  603  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>