More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0005 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_rrlVIMSS1365779  23S ribosomal RNA  88.99 
 
 		 2875 bp  3148    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.069762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0022  23S ribosomal RNA  88.49 
 
 		 2873 bp  2993    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0043  23S ribosomal RNA  88.49 
 
 		 2873 bp  2993    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0009  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2812 bp  1620    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00993914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0044  23S ribosomal RNA  88.49 
 
 		 2873 bp  2993    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223039  normal  0.259444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0040  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2812 bp  1620    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0789555  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0039  23S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 2885 bp  2565    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0009  23S ribosomal RNA  90.35 
 
 		 2826 bp  1536    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.214919  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0015  23S ribosomal RNA  90.35 
 
 		 2826 bp  1536    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0330933  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0037  23S ribosomal RNA  90.35 
 
 		 2826 bp  1536    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrlVIMSS1365801  23S ribosomal RNA  87.95 
 
 		 2876 bp  2920    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.646586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0027  23S ribosomal RNA  86.83 
 
 		 2885 bp  2575    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.877098 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0039  23S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 2875 bp  2696    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0009  23S ribosomal RNA  90.15 
 
 		 2830 bp  1509    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.349065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0023  23S ribosomal RNA  90.15 
 
 		 2830 bp  1509    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00726109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0038  23S ribosomal RNA  90.15 
 
 		 2830 bp  1509    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0050  23S ribosomal RNA  90.15 
 
 		 2830 bp  1509    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0021  23S ribosomal RNA  88.49 
 
 		 2873 bp  2993    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380861  normal  0.0691187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0047  23S ribosomal RNA  89.92 
 
 		 2866 bp  2926    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0050  23S ribosomal RNA  89.92 
 
 		 2866 bp  2926    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0019  23S ribosomal RNA  89.9 
 
 		 2866 bp  2924    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0048  23S ribosomal RNA  89.9 
 
 		 2866 bp  2924    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0012  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 		 2874 bp  2656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0005  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2878 bp  5705    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  normal  0.226788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0051  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2878 bp  5705    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00795869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrlVIMSS1365721  23S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 2874 bp  2648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrlVIMSS1365720  23S ribosomal RNA  88.69 
 
 		 2874 bp  2672    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.576306  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrlVIMSS1365723  23S ribosomal RNA  88.9 
 
 		 2874 bp  2732    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0028  23S ribosomal RNA  90.35 
 
 		 2826 bp  1536    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.216224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0017  23S ribosomal RNA  87.19 
 
 		 2881 bp  2704    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00563866  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0026  23S ribosomal RNA  87.19 
 
 		 2881 bp  2704    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0380679  decreased coverage  0.000773701 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrlVIMSS1365778  23S ribosomal RNA  88.92 
 
 		 2873 bp  3116    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrlVIMSS1365722  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2876 bp  2664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0013  23S ribosomal RNA  86.8 
 
 		 2885 bp  2567    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 2909 bp  626  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2907 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2907 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0342  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2909 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0924378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2909 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2909 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2909 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2926 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2907 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2907 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2907 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2907 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2907 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0185  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2909 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000705814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0105  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2909 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2912 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2912 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2912 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2911 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0325  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2909 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0212799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0331  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2909 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2908 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0010  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2909 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0263199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0303  23S ribosomal RNA  89.11 
 
 		 2909 bp  618  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>