More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_R0043 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0037  23S ribosomal RNA  92.41 
 
 
2826 bp  1594    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0009  23S ribosomal RNA  92.41 
 
 
2826 bp  1594    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.214919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0027  23S ribosomal RNA  89.76 
 
 
2885 bp  3277    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.877098 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0043  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2873 bp  5695    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0039  23S ribosomal RNA  89.75 
 
 
2885 bp  3275    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0021  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2873 bp  5695    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380861  normal  0.0691187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0040  23S ribosomal RNA  92.96 
 
 
2812 bp  1798    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0789555  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0039  23S ribosomal RNA  85.83 
 
 
2875 bp  2244    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0009  23S ribosomal RNA  90.28 
 
 
2830 bp  1520    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.349065  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0023  23S ribosomal RNA  90.28 
 
 
2830 bp  1520    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00726109  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0038  23S ribosomal RNA  90.28 
 
 
2830 bp  1520    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281895  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0050  23S ribosomal RNA  90.28 
 
 
2830 bp  1520    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0047  23S ribosomal RNA  87.45 
 
 
2866 bp  2381    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0050  23S ribosomal RNA  87.45 
 
 
2866 bp  2381    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0019  23S ribosomal RNA  87.1 
 
 
2866 bp  1594    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0048  23S ribosomal RNA  87.1 
 
 
2866 bp  1594    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0013  23S ribosomal RNA  89.76 
 
 
2885 bp  3277    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0022  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2873 bp  5695    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0015  23S ribosomal RNA  92.41 
 
 
2826 bp  1594    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0330933  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0044  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2873 bp  5695    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223039  normal  0.259444 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrlVIMSS1365801  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2876 bp  2313    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.646586  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0009  23S ribosomal RNA  92.96 
 
 
2812 bp  1798    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00993914  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0028  23S ribosomal RNA  92.41 
 
 
2826 bp  1594    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.216224  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0012  23S ribosomal RNA  87.21 
 
 
2874 bp  2212    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0005  23S ribosomal RNA  88.49 
 
 
2878 bp  2993    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  normal  0.226788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0051  23S ribosomal RNA  88.49 
 
 
2878 bp  2993    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00795869  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0026  23S ribosomal RNA  88.52 
 
 
2881 bp  2672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0380679  decreased coverage  0.000773701 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrlVIMSS1365778  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2873 bp  2490    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrlVIMSS1365722  23S ribosomal RNA  87.25 
 
 
2876 bp  2220    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrlVIMSS1365779  23S ribosomal RNA  88.15 
 
 
2875 bp  2522    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.069762 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrlVIMSS1365723  23S ribosomal RNA  87.37 
 
 
2874 bp  2246    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrlVIMSS1365721  23S ribosomal RNA  87 
 
 
2874 bp  2187    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrlVIMSS1365720  23S ribosomal RNA  87.3 
 
 
2874 bp  2228    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.576306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0017  23S ribosomal RNA  88.52 
 
 
2881 bp  2672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00563866  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0018  23S ribosomal RNA  88.91 
 
 
2923 bp  609  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.193918  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0064  23S ribosomal RNA  88.91 
 
 
2923 bp  609  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0019  23S ribosomal RNA  88.91 
 
 
2923 bp  609  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0080  23S ribosomal RNA  88.91 
 
 
2923 bp  609  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0069  23S ribosomal RNA  88.91 
 
 
2923 bp  609  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0069  23S ribosomal RNA  88.91 
 
 
2923 bp  609  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0064  23S ribosomal RNA  88.91 
 
 
2923 bp  609  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0080  23S ribosomal RNA  88.91 
 
 
2923 bp  609  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0006  23S ribosomal RNA  89.03 
 
 
2923 bp  601  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  88.73 
 
 
2922 bp  601  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  88.73 
 
 
2922 bp  601  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  88.73 
 
 
2922 bp  601  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  88.73 
 
 
2922 bp  601  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  88.73 
 
 
2922 bp  601  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  88.73 
 
 
2922 bp  601  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0022  23S ribosomal RNA  89.03 
 
 
2923 bp  601  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0006  23S ribosomal RNA  89.03 
 
 
2923 bp  601  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0021  23S ribosomal RNA  89.03 
 
 
2923 bp  601  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2909 bp  593  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  88.55 
 
 
2908 bp  593  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2908 bp  585  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2908 bp  585  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2909 bp  585  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2909 bp  585  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2908 bp  585  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2907 bp  585  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2908 bp  585  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2907 bp  585  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2912 bp  585  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  88.37 
 
 
2911 bp  585  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>