More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_R0017 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  90.4 
 
 		 2922 bp  692    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  90.4 
 
 		 2922 bp  692    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  90.4 
 
 		 2922 bp  692    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  90.4 
 
 		 2922 bp  692    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  90.4 
 
 		 2922 bp  692    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  90.4 
 
 		 2922 bp  692    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2909 bp  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2909 bp  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2909 bp  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2926 bp  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0068  23S ribosomal RNA  86.02 
 
 		 2908 bp  864    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00625643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0059  23S ribosomal RNA  86.02 
 
 		 2908 bp  864    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0056  23S ribosomal RNA  86.02 
 
 		 2908 bp  864    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000789359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0039  23S ribosomal RNA  86.02 
 
 		 2908 bp  864    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000978357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0176  hypothetical protein  100 
 
 		 375 bp  743    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.713236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0008  hypothetical protein  100 
 
 		 354 bp  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1266  hypothetical protein  100 
 
 		 375 bp  743    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2851 bp  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-7  23S ribosomal RNA  91.2 
 
 		 2911 bp  722    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-9  23S ribosomal RNA  91.2 
 
 		 2911 bp  722    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2912 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2912 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2912 bp  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  91.21 
 
 		 2913 bp  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2911 bp  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2912 bp  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SG  23S ribosomal RNA  91.2 
 
 		 2908 bp  722    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SI  23S ribosomal RNA  91.2 
 
 		 2908 bp  722    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000225912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  91.37 
 
 		 2908 bp  729    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1260  hypothetical protein  100 
 
 		 375 bp  743    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0405  hypothetical protein  99.44 
 
 		 354 bp  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.743042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  87.83 
 
 		 2972 bp  1505    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2999  23S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 2909 bp  890    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3002  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2908 bp  898    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3005  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2908 bp  898    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3008  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2908 bp  898    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3011  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2908 bp  898    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3014  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2908 bp  898    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3017  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2908 bp  898    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3020  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2907 bp  898    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r02  23S ribosomal RNA  86.03 
 
 		 2908 bp  906    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r05  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2908 bp  898    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r08  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2908 bp  898    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r11  23S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 2908 bp  890    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r14  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2908 bp  898    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r17  23S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 2908 bp  890    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r20  23S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 2908 bp  890    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r23  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2908 bp  898    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r25  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2907 bp  898    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r29  23S ribosomal RNA  85.93 
 
 		 2907 bp  898    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 3529 bp  716    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 3088 bp  716    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0021  23S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 3260 bp  716    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2528  hypothetical protein  99.72 
 
 		 354 bp  694    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 2927 bp  961    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2947  hypothetical protein  100 
 
 		 375 bp  743    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>