More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflr05 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  Gs23SA  23S ribosomal RNA  84.99 
 
 		 2958 bp  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  84.99 
 
 		 2958 bp  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2922 bp  769    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2922 bp  769    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2922 bp  769    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2922 bp  769    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2922 bp  769    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2922 bp  769    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R06  23S ribosomal RNA  86.53 
 
 		 2733 bp  841    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0018  23S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 2984 bp  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.390452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0064  23S ribosomal RNA  83.82 
 
 		 2912 bp  690    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00853635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0055  23S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 2954 bp  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0079  23S ribosomal RNA  83.82 
 
 		 2913 bp  690    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0019  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2923 bp  769    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 2927 bp  722    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  84.57 
 
 		 2927 bp  714    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 3129 bp  690    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0021  23S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 3260 bp  664    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 3088 bp  656    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  83.81 
 
 		 3529 bp  656    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  84.22 
 
 		 2933 bp  678    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  84.22 
 
 		 2933 bp  678    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0071  23S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 2912 bp  706    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.19372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  84.32 
 
 		 2933 bp  686    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0010  23S ribosomal RNA  84.57 
 
 		 2927 bp  714    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  84.53 
 
 		 2933 bp  702    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0009  23S ribosomal RNA  83.82 
 
 		 2912 bp  690    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.363949  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0018  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2923 bp  769    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.193918  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0006  23S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 2923 bp  761    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r1371  23S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 2888 bp  749    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0045  23S ribosomal RNA  84.48 
 
 		 2984 bp  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0069  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2923 bp  769    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0069  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2923 bp  769    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0022  23S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 2923 bp  761    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0064  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2923 bp  769    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 3129 bp  690    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0024  23S ribosomal RNA  84.91 
 
 		 2847 bp  714    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00320172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 3129 bp  690    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  84.79 
 
 		 2927 bp  729    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr02  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2736 bp  5424    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr05  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2736 bp  5424    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  84.32 
 
 		 2933 bp  686    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  84.22 
 
 		 2933 bp  678    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  84.32 
 
 		 2933 bp  686    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  84.32 
 
 		 2933 bp  686    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0020  23S ribosomal RNA  83.82 
 
 		 3062 bp  690    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000158535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0060  23S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 2954 bp  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0021  23S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 2954 bp  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  84.22 
 
 		 2932 bp  678    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0004  23S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 2928 bp  722    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0070  23S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 2954 bp  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  84.22 
 
 		 2935 bp  678    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0049  23S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 2956 bp  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0054  23S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 2956 bp  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  85.53 
 
 		 2983 bp  773    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  85.21 
 
 		 2983 bp  749    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  84.79 
 
 		 2927 bp  729    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0080  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2923 bp  769    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0021  23S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 2923 bp  761    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0006  23S ribosomal RNA  85.48 
 
 		 2923 bp  761    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0080  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2923 bp  769    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0064  23S ribosomal RNA  85.59 
 
 		 2923 bp  769    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0037  23S ribosomal RNA  84.57 
 
 		 2927 bp  714    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r0655  23S ribosomal RNA  85.29 
 
 		 2888 bp  749    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 3129 bp  690    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0008  23S ribosomal RNA  84.91 
 
 		 2847 bp  714    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237981  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0379  23S ribosomal RNA  91.08 
 
 		 2894 bp  3418    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0832  23S ribosomal RNA  91.19 
 
 		 2894 bp  3441    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0024  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 2556 bp  710    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0314547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0051  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 2556 bp  710    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0486976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0061  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 2556 bp  710    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0035  23S ribosomal RNA  84.67 
 
 		 2556 bp  710    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.381491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  84.68 
 
 		 2927 bp  722    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0036  23S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 2850 bp  636  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0021  23S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 2850 bp  636  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.335485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0031  23S ribosomal RNA  84.07 
 
 		 2850 bp  636  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0074  23S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 2609 bp  634  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00146818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0014  23S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 2609 bp  634  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.609994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0004  23S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 2817 bp  634  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0023  23S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 2816 bp  634  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0053  23S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 2814 bp  634  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.652954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0076  23S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 2798 bp  634  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0071  23S ribosomal RNA  83.96 
 
 		 2850 bp  628  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.764689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0036  23S ribosomal RNA  84.18 
 
 		 2934 bp  624  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0125  23S ribosomal RNA  82.38 
 
 		 2902 bp  605  1e-170  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0301  23S ribosomal RNA  82.3 
 
 		 2902 bp  597  1e-168  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.339976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  82.91 
 
 		 2897 bp  591  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  82.91 
 
 		 2897 bp  591  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0037  23S ribosomal RNA  82.98 
 
 		 2774 bp  585  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0041  23S ribosomal RNA  82.98 
 
 		 2774 bp  585  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0004  23S ribosomal RNA  82.98 
 
 		 2774 bp  585  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 2897 bp  583  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 2898 bp  583  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 2897 bp  583  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0017  23S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 3592 bp  577  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0004  23S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 3592 bp  577  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0048  23S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 3592 bp  577  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0060  23S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 3592 bp  577  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.129555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0051  23S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 3592 bp  577  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0032  23S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 3592 bp  577  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.287543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>