More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0301 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0301  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2902 bp  5753    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.339976  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0125  23S ribosomal RNA  99.66 
 
 		 2902 bp  5673    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr02  23S ribosomal RNA  82.3 
 
 		 2736 bp  597  1e-168  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr05  23S ribosomal RNA  82.3 
 
 		 2736 bp  597  1e-168  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0015  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2978 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418003  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0036  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2978 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0832  23S ribosomal RNA  85.17 
 
 		 2894 bp  402  1e-109  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0014  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2985 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0035  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2985 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0015  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2647 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0278  23S ribosomal RNA segment  84.89 
 
 		 4345 bp  394  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000810998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0061  23S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 2556 bp  394  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0051  23S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 2556 bp  394  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0486976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0035  23S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 2556 bp  394  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.381491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0004  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 2624 bp  396  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1912  Large Subunit Ribosomal RNA; lsuRNA; 23S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 4346 bp  394  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.130137  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0379  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2894 bp  394  1e-107  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2897 bp  394  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2897 bp  394  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2897 bp  394  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2898 bp  394  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 		 2897 bp  394  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0007  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 2624 bp  396  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0024  23S ribosomal RNA  84.63 
 
 		 2556 bp  394  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0314547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0029  23S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 2979 bp  392  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0559165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0040  23S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 2979 bp  392  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0036  23S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 2647 bp  392  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0040  23S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 2883 bp  392  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0004  23S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 2884 bp  389  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0016  23S ribosomal RNA  84.01 
 
 		 2884 bp  389  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0075  23S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 2940 bp  387  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.60998 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0031  23S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 2940 bp  387  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0024  23S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 2940 bp  387  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0008  23S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 2940 bp  387  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  hitchhiker  0.00128582 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0005  23S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 2884 bp  387  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0054  23S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 2884 bp  387  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.879203  normal  0.943233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0082  23S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 2940 bp  387  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0069  23S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 2923 bp  379  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0080  23S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 2923 bp  379  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0018  23S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 2923 bp  379  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.193918  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0064  23S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 2923 bp  379  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65244  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0080  23S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 2923 bp  379  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0064  23S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 2923 bp  379  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0019  23S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 2923 bp  379  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0069  23S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 2923 bp  379  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0010  23S ribosomal RNA  80 
 
 		 2925 bp  377  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0025  23S ribosomal RNA  80 
 
 		 2925 bp  377  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.610781  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0063  23S ribosomal RNA  80 
 
 		 2924 bp  377  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00771367  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0004  23S ribosomal RNA  80 
 
 		 2925 bp  377  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545462  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0078  23S ribosomal RNA  80 
 
 		 2925 bp  377  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2922 bp  371  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2922 bp  371  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2922 bp  371  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3543  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_23s_rrlB  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0157965  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0010  23S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 2878 bp  371  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0250239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_Bm23SD  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000295775  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr02  23S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 2783 bp  373  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr05  23S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 2783 bp  373  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr08  23S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 2861 bp  373  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr02  23S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 2861 bp  373  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr05  23S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 2861 bp  373  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr08  23S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 2861 bp  373  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0005  23S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 2883 bp  371  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00123677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0021  23S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 2883 bp  371  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000170466  normal  0.809374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0030  23S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 2883 bp  371  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00125735  unclonable  0.000000161154 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0006  23S ribosomal RNA  83.94 
 
 		 2923 bp  371  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1476  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000361386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3559  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000413254  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0087  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564636  normal  0.192988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0010  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0501541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0018  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000431257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0028  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0640603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0072  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560975  normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0004  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1990  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00140855  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0004  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000269273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1331  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.120209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2044  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2881 bp  371  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0408175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1099  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2881 bp  371  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000727484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2895  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2881 bp  371  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0262305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3092  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000732021  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0926  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000409078  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0006  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00194355  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0078  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2818 bp  371  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0052  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0063  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2881 bp  371  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0822866  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0074  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2881 bp  371  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407345  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0086  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2881 bp  371  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0002  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0458298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0010  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131744  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0020  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00244053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0064  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0081  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232071  normal  0.0354875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0087  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00689972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0002  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522132  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0010  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0019  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0062  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2882 bp  371  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.604931  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0078  23S ribosomal RNA  83.8 
 
 		 2881 bp  371  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.0353755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>