More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0125 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0125  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2902 bp  5753    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0301  23S ribosomal RNA  99.66 
 
 		 2902 bp  5673    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.339976  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr02  23S ribosomal RNA  82.38 
 
 		 2736 bp  605  1e-170  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflr05  23S ribosomal RNA  82.38 
 
 		 2736 bp  605  1e-170  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0832  23S ribosomal RNA  82.43 
 
 		 2894 bp  579  1.0000000000000001e-162  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0379  23S ribosomal RNA  82.34 
 
 		 2894 bp  571  1e-160  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0015  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2978 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418003  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0015  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2647 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0014  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2985 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0035  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2985 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0036  23S ribosomal RNA  84.6 
 
 		 2978 bp  400  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2897 bp  398  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2897 bp  398  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2897 bp  398  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2898 bp  398  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  85.03 
 
 		 2897 bp  398  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0004  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 2624 bp  396  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0016  23S ribosomal RNA  84.12 
 
 		 2884 bp  396  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0004  23S ribosomal RNA  84.12 
 
 		 2884 bp  396  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0007  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 		 2624 bp  396  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0024  23S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 2556 bp  396  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0314547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0035  23S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 2556 bp  396  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.381491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0051  23S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 2556 bp  396  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0486976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0061  23S ribosomal RNA  84.44 
 
 		 2556 bp  396  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0040  23S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 2883 bp  392  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0040  23S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 2979 bp  392  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0029  23S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 2979 bp  392  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0559165 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0036  23S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 2647 bp  392  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0008  23S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 2940 bp  389  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  hitchhiker  0.00128582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0024  23S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 2940 bp  389  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0031  23S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 2940 bp  389  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0075  23S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 2940 bp  389  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.60998 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0082  23S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 2940 bp  389  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0063  23S ribosomal RNA  80.1 
 
 		 2924 bp  385  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00771367  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0025  23S ribosomal RNA  80.1 
 
 		 2925 bp  385  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.610781  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0078  23S ribosomal RNA  80.1 
 
 		 2925 bp  385  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1912  Large Subunit Ribosomal RNA; lsuRNA; 23S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 4346 bp  387  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.130137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0005  23S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 2884 bp  387  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0054  23S ribosomal RNA  84.11 
 
 		 2884 bp  387  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.879203  normal  0.943233 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0010  23S ribosomal RNA  80.1 
 
 		 2925 bp  385  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0004  23S ribosomal RNA  80.1 
 
 		 2925 bp  385  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545462  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0278  23S ribosomal RNA segment  84.77 
 
 		 4345 bp  387  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000810998  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0018  23S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 2923 bp  383  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.193918  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0064  23S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 2923 bp  383  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65244  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0069  23S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 2923 bp  383  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0080  23S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 2923 bp  383  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0064  23S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 2923 bp  383  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0080  23S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 2923 bp  383  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0069  23S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 2923 bp  383  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0019  23S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 2923 bp  383  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0010  23S ribosomal RNA  83.86 
 
 		 2878 bp  379  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0250239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 2922 bp  375  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 2922 bp  375  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 2922 bp  375  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  84.58 
 
 		 2922 bp  375  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr02  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2783 bp  375  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr05  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2783 bp  375  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr08  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2861 bp  375  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr02  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2861 bp  375  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr05  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2861 bp  375  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr08  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 2861 bp  375  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0022  23S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 2923 bp  375  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0049  23S ribosomal RNA  80 
 
 		 2925 bp  377  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0006  23S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 2923 bp  375  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0021  23S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 2923 bp  375  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0006  23S ribosomal RNA  83.73 
 
 		 2923 bp  375  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1895  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3566  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416025  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3830  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_23s_rrlB  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0157965  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_Bm23SC  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000573887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_Bm23SD  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000295775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0021  23S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 2883 bp  371  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000170466  normal  0.809374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0030  23S ribosomal RNA  83.74 
 
 		 2883 bp  371  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00125735  unclonable  0.000000161154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0019  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2820 bp  373  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0050  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2820 bp  373  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0060  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2820 bp  373  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996715  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0073  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2820 bp  373  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0081  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2820 bp  373  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0084  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2820 bp  373  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0002  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000280391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0004  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3540  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0074777  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2044  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2881 bp  373  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0408175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1099  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2881 bp  373  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000727484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2895  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2881 bp  373  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0262305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3092  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000732021  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3769  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734157  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0906  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3543  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0497  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0006  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00194355  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0926  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000409078  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0064  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0087  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00689972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0002  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522132  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0010  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0019  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0062  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2882 bp  373  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.604931  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0078  23S ribosomal RNA  83.58 
 
 		 2881 bp  373  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.0353755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>