More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_R0036 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_R0100  23S ribosomal RNA  83.92 
 
 		 2903 bp  648    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SA  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 		 2958 bp  1114    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 		 2958 bp  1114    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  83.35 
 
 		 2922 bp  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  83.35 
 
 		 2922 bp  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  83.35 
 
 		 2922 bp  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  83.35 
 
 		 2922 bp  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  83.35 
 
 		 2922 bp  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  83.35 
 
 		 2922 bp  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SA  23S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 2904 bp  716    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SB  23S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 2904 bp  716    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00482  23S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 2818 bp  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05581  23S ribosomal RNA  84.9 
 
 		 2879 bp  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0577053  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_003295  RS05738  23S ribosomal RNA  84.79 
 
 		 2818 bp  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00792768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05423  ribosomal RNA-23S  84.9 
 
 		 2880 bp  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA71  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 		 2903 bp  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0658993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0005  23S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 2883 bp  646    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00123677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0021  23S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 2883 bp  646    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000170466  normal  0.809374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0030  23S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 2883 bp  646    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00125735  unclonable  0.000000161154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0042  23S ribosomal RNA  84.85 
 
 		 2883 bp  646    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00870096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0002  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 2882 bp  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000280391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1476  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 2882 bp  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000361386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3559  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 2882 bp  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000413254  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1911  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 2882 bp  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000130607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0013  23S ribosomal RNA  85.09 
 
 		 2913 bp  749    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0027  23S ribosomal RNA  85.09 
 
 		 2913 bp  749    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0049  23S ribosomal RNA  87.05 
 
 		 2956 bp  1138    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0054  23S ribosomal RNA  87.05 
 
 		 2956 bp  1138    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175608  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0087  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564636  normal  0.192988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0010  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0501541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0018  23S ribosomal RNA  85 
 
 		 2882 bp  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000431257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0028  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0640603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0072  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560975  normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0004  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  86.82 
 
 		 2983 bp  1156    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  87.77 
 
 		 2983 bp  1132    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0004  23S ribosomal RNA  90.49 
 
 		 2817 bp  672    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0023  23S ribosomal RNA  90.49 
 
 		 2816 bp  672    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0053  23S ribosomal RNA  90.49 
 
 		 2814 bp  672    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.652954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0076  23S ribosomal RNA  90.69 
 
 		 2798 bp  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0007  23S ribosomal RNA  85.12 
 
 		 2758 bp  712    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0021  23S ribosomal RNA  85.12 
 
 		 2758 bp  712    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0043  23S ribosomal RNA  85.12 
 
 		 2758 bp  712    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0061  23S ribosomal RNA  85.12 
 
 		 2758 bp  712    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2044  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 2881 bp  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0408175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1099  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 2881 bp  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000727484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2895  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 2881 bp  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0262305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3092  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 		 2882 bp  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000732021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0014  23S ribosomal RNA  99.7 
 
 		 2985 bp  5178    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0035  23S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 2985 bp  5186    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0014  23S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 2872 bp  698    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0042  23S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 2872 bp  698    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0002  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2905 bp  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.905525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0010  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2905 bp  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0016  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2905 bp  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.427778  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0047  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2905 bp  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0106  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2905 bp  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.492781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0116  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2905 bp  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0121  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2905 bp  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0126  23S ribosomal RNA  84.69 
 
 		 2905 bp  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 2897 bp  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 2897 bp  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 2897 bp  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 2898 bp  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 2897 bp  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0003  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0037  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169917  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0052  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0063  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0822866  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0074  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407345  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0086  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0007  23S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 2898 bp  710    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0012  23S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 2898 bp  710    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31433 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0020  23S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 2747 bp  678    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.730998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0040  23S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 2747 bp  678    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0002  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0458298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0010  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131744  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0020  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00244053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0064  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0081  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232071  normal  0.0354875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0087  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00689972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0002  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522132  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0010  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0019  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0062  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2882 bp  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.604931  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0078  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.0353755 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0085  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.271207  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0004  23S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 2774 bp  710    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0037  23S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 2774 bp  710    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0041  23S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 2774 bp  710    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0024  23S ribosomal RNA  86.99 
 
 		 2556 bp  1076    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0314547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0035  23S ribosomal RNA  86.99 
 
 		 2556 bp  1076    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.381491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0051  23S ribosomal RNA  86.99 
 
 		 2556 bp  1076    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0486976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0061  23S ribosomal RNA  86.99 
 
 		 2556 bp  1076    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0009  23S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 2900 bp  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.517564  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0019  23S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 2900 bp  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00407691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0056  23S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 2900 bp  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0008  23S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 2940 bp  805    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  hitchhiker  0.00128582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0024  23S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 2940 bp  805    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0031  23S ribosomal RNA  85.08 
 
 		 2940 bp  805    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>