More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_R0014 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  Gs23SA  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 
2958 bp  1122    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 
2958 bp  1122    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SA  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 
2902 bp  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145616  hitchhiker  0.000134511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SB  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 
2902 bp  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  hitchhiker  0.000114916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SC  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 
2902 bp  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0640928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SD  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 
2902 bp  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507419  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SE  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 
2902 bp  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564865  normal  0.184682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SF  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 
2902 bp  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SG  23S ribosomal RNA  84.26 
 
 
2902 bp  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  83.45 
 
 
2922 bp  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  83.45 
 
 
2922 bp  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  83.45 
 
 
2922 bp  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  83.45 
 
 
2922 bp  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  83.45 
 
 
2922 bp  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  83.45 
 
 
2922 bp  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00482  23S ribosomal RNA  84.79 
 
 
2818 bp  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128279  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS05581  23S ribosomal RNA  84.79 
 
 
2879 bp  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0577053  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_003296  RS05423  ribosomal RNA-23S  84.79 
 
 
2880 bp  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r02  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 
2903 bp  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r05  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 
2903 bp  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r08  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 
2903 bp  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r11  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 
2903 bp  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r14  23S ribosomal RNA  84.46 
 
 
2903 bp  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA16  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 
2903 bp  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.048152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA49  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 
2903 bp  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832187  normal  0.473588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA7  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 
2903 bp  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.685402  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA71  23S ribosomal RNA  84.66 
 
 
2903 bp  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0658993  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA80  23S ribosomal RNA  84.56 
 
 
2903 bp  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0495778  normal  0.0181156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0013  23S ribosomal RNA  85.19 
 
 
2913 bp  757    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0027  23S ribosomal RNA  85.19 
 
 
2913 bp  757    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R15  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 
2892 bp  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28387  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R4  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 
2892 bp  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657154  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R44  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 
2892 bp  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R57  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 
2892 bp  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344499  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R78  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 
2892 bp  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0420771  normal  0.0126919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R91  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 
2892 bp  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000653016  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0049  23S ribosomal RNA  87.13 
 
 
2956 bp  1146    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0054  23S ribosomal RNA  87.13 
 
 
2956 bp  1146    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175608  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0087  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564636  normal  0.192988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0010  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0501541  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0018  23S ribosomal RNA  84.89 
 
 
2882 bp  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000431257  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0028  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0640603  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0072  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560975  normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0004  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923304  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  86.9 
 
 
2983 bp  1164    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  87.85 
 
 
2983 bp  1140    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0004  23S ribosomal RNA  90.68 
 
 
2817 bp  680    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0023  23S ribosomal RNA  90.68 
 
 
2816 bp  680    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0053  23S ribosomal RNA  90.68 
 
 
2814 bp  680    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.652954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0076  23S ribosomal RNA  90.88 
 
 
2798 bp  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0007  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 
2758 bp  720    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0021  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 
2758 bp  720    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0043  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 
2758 bp  720    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0061  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 
2758 bp  720    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0014  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2985 bp  5917    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0035  23S ribosomal RNA  99.97 
 
 
2985 bp  5909    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0014  23S ribosomal RNA  85.52 
 
 
2872 bp  706    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368239  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0042  23S ribosomal RNA  85.52 
 
 
2872 bp  706    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.121457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0002  23S ribosomal RNA  84.58 
 
 
2905 bp  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.905525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0047  23S ribosomal RNA  84.58 
 
 
2905 bp  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0106  23S ribosomal RNA  84.58 
 
 
2905 bp  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.492781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  85.5 
 
 
2897 bp  720    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  85.5 
 
 
2897 bp  720    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  85.5 
 
 
2897 bp  720    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  85.5 
 
 
2898 bp  720    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  85.5 
 
 
2897 bp  720    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0003  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2881 bp  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0037  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2881 bp  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169917  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0052  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0063  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2881 bp  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0822866  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0074  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2881 bp  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407345  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0086  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2881 bp  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0007  23S ribosomal RNA  84.62 
 
 
2898 bp  702    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237096  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0012  23S ribosomal RNA  84.62 
 
 
2898 bp  702    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.31433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  83.54 
 
 
3529 bp  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  83.54 
 
 
3088 bp  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0020  23S ribosomal RNA  84.92 
 
 
2747 bp  686    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.730998  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0040  23S ribosomal RNA  84.92 
 
 
2747 bp  686    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0002  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0458298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0010  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131744  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0020  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00244053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0064  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0081  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232071  normal  0.0354875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0087  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00689972  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08600  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 
2891 bp  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000197684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62060  23S ribosomal RNA  84.39 
 
 
2891 bp  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0546487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70880  23S ribosomal RNA  84.29 
 
 
2891 bp  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.560692 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0002  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522132  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0010  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0019  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0062  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.604931  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0078  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2881 bp  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.0353755 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0085  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2881 bp  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.271207  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0004  23S ribosomal RNA  85.19 
 
 
2774 bp  718    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174681  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0037  23S ribosomal RNA  85.19 
 
 
2774 bp  718    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0041  23S ribosomal RNA  85.19 
 
 
2774 bp  718    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0024  23S ribosomal RNA  87.07 
 
 
2556 bp  1084    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0314547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0035  23S ribosomal RNA  87.07 
 
 
2556 bp  1084    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.381491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0051  23S ribosomal RNA  87.07 
 
 
2556 bp  1084    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0486976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0061  23S ribosomal RNA  87.07 
 
 
2556 bp  1084    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>