More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_R0040 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  Gs23SA  23S ribosomal RNA  87.91 
 
 
2958 bp  1168    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs23SB  23S ribosomal RNA  87.91 
 
 
2958 bp  1168    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SA  23S ribosomal RNA  84.55 
 
 
2902 bp  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145616  hitchhiker  0.000134511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SB  23S ribosomal RNA  84.55 
 
 
2902 bp  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  hitchhiker  0.000114916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SC  23S ribosomal RNA  84.55 
 
 
2902 bp  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0640928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SD  23S ribosomal RNA  84.55 
 
 
2902 bp  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507419  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SE  23S ribosomal RNA  84.55 
 
 
2902 bp  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564865  normal  0.184682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SF  23S ribosomal RNA  84.55 
 
 
2902 bp  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SG  23S ribosomal RNA  84.55 
 
 
2902 bp  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SA  23S ribosomal RNA  85.39 
 
 
2904 bp  769    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SB  23S ribosomal RNA  85.39 
 
 
2904 bp  769    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00482  23S ribosomal RNA  84.9 
 
 
2818 bp  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128279  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS05581  23S ribosomal RNA  84.9 
 
 
2879 bp  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0577053  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_003295  RS05738  23S ribosomal RNA  84.79 
 
 
2818 bp  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00792768  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05423  ribosomal RNA-23S  84.9 
 
 
2880 bp  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r02  23S ribosomal RNA  84.95 
 
 
2903 bp  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r05  23S ribosomal RNA  84.95 
 
 
2903 bp  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r08  23S ribosomal RNA  84.95 
 
 
2903 bp  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r11  23S ribosomal RNA  84.95 
 
 
2903 bp  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r14  23S ribosomal RNA  84.85 
 
 
2903 bp  724    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA16  23S ribosomal RNA  84.95 
 
 
2903 bp  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.048152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA49  23S ribosomal RNA  84.95 
 
 
2903 bp  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832187  normal  0.473588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA7  23S ribosomal RNA  84.95 
 
 
2903 bp  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.685402  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA71  23S ribosomal RNA  85.04 
 
 
2903 bp  739    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0658993  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA80  23S ribosomal RNA  84.95 
 
 
2903 bp  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0495778  normal  0.0181156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0005  23S ribosomal RNA  83.6 
 
 
2883 bp  716    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00123677  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0021  23S ribosomal RNA  83.6 
 
 
2883 bp  716    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000170466  normal  0.809374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0030  23S ribosomal RNA  83.6 
 
 
2883 bp  716    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00125735  unclonable  0.000000161154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0042  23S ribosomal RNA  83.6 
 
 
2883 bp  716    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00870096  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0002  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 
2882 bp  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000280391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1476  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 
2882 bp  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000361386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3559  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 
2882 bp  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000413254  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1911  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 
2882 bp  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000130607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0013  23S ribosomal RNA  84.05 
 
 
2913 bp  781    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0027  23S ribosomal RNA  84.05 
 
 
2913 bp  781    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R15  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 
2892 bp  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28387  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R4  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 
2892 bp  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657154  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R44  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 
2892 bp  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R57  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 
2892 bp  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344499  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R78  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 
2892 bp  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0420771  normal  0.0126919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R91  23S ribosomal RNA  84.33 
 
 
2892 bp  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000653016  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0049  23S ribosomal RNA  87.27 
 
 
2956 bp  1172    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0054  23S ribosomal RNA  87.27 
 
 
2956 bp  1172    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175608  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0087  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564636  normal  0.192988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0010  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0501541  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0018  23S ribosomal RNA  85 
 
 
2882 bp  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000431257  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0028  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0640603  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0072  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560975  normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0004  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923304  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0014  23S ribosomal RNA  87.03 
 
 
2983 bp  1199    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58284  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  87.91 
 
 
2983 bp  1168    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0004  23S ribosomal RNA  90.5 
 
 
2817 bp  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0023  23S ribosomal RNA  90.5 
 
 
2816 bp  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0053  23S ribosomal RNA  90.5 
 
 
2814 bp  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.652954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0076  23S ribosomal RNA  90.5 
 
 
2798 bp  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0007  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 
2758 bp  720    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0021  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 
2758 bp  720    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0043  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 
2758 bp  720    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0061  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 
2758 bp  720    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2044  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 
2881 bp  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0408175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1099  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 
2881 bp  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000727484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2895  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 
2881 bp  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0262305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3092  23S ribosomal RNA  84.77 
 
 
2882 bp  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000732021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0014  23S ribosomal RNA  96.62 
 
 
2985 bp  5069    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0035  23S ribosomal RNA  96.65 
 
 
2985 bp  5077    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0014  23S ribosomal RNA  84.28 
 
 
2872 bp  696    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368239  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0042  23S ribosomal RNA  84.28 
 
 
2872 bp  696    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.121457 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0005  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 
2884 bp  648    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133084  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0054  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 
2884 bp  648    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.879203  normal  0.943233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  85.73 
 
 
2897 bp  735    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  85.73 
 
 
2897 bp  735    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  85.73 
 
 
2897 bp  735    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  85.73 
 
 
2898 bp  735    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  85.73 
 
 
2897 bp  735    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0003  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0037  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169917  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0052  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0063  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0822866  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0074  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407345  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0086  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0007  23S ribosomal RNA  84.91 
 
 
2898 bp  731    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237096  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0012  23S ribosomal RNA  84.91 
 
 
2898 bp  731    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.31433 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0020  23S ribosomal RNA  84.92 
 
 
2747 bp  686    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.730998  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0040  23S ribosomal RNA  84.92 
 
 
2747 bp  686    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0002  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0458298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0010  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131744  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0020  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00244053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0064  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0081  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232071  normal  0.0354875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0087  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00689972  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08600  23S ribosomal RNA  83.12 
 
 
2891 bp  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000197684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62060  23S ribosomal RNA  83.21 
 
 
2891 bp  690    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0546487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70880  23S ribosomal RNA  83.12 
 
 
2891 bp  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.560692 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0002  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522132  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0010  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0019  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0062  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2882 bp  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.604931  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0078  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.0353755 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0085  23S ribosomal RNA  85.11 
 
 
2881 bp  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.271207  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0016  23S ribosomal RNA  84.79 
 
 
2811 bp  888    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629398  normal  0.58938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>