More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0015 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0033  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2940 bp  5828    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0049  23S ribosomal RNA  90.37 
 
 		 2911 bp  3051    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.147813  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0017  23S ribosomal RNA  90.64 
 
 		 3993 bp  2361    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0503032  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0027  23S ribosomal RNA  87.7 
 
 		 3023 bp  2656    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.26037  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0028  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2940 bp  5828    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.973163  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0020  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2940 bp  5828    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0015  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2940 bp  5828    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0015  23S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 2902 bp  664    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.770252  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0054  23S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 2902 bp  664    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.439504  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0027  23S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 3718 bp  1421    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0025  23S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 3027 bp  569  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0041  23S ribosomal RNA  83.22 
 
 		 3027 bp  569  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0513089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  82.51 
 
 		 3129 bp  507  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  82.51 
 
 		 3129 bp  507  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  82.51 
 
 		 3129 bp  507  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  82.51 
 
 		 3129 bp  507  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0031  23S ribosomal RNA  82.01 
 
 		 3357 bp  488  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0008  23S ribosomal RNA  82.01 
 
 		 3357 bp  488  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0002  23S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 2609 bp  480  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000051832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0069  23S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 2609 bp  480  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0021  23S ribosomal RNA  81.87 
 
 		 2609 bp  480  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0041  23S ribosomal RNA  81.76 
 
 		 2618 bp  472  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0588399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  81.66 
 
 		 2943 bp  472  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  81.7 
 
 		 2946 bp  470  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  81.55 
 
 		 2944 bp  464  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  81.55 
 
 		 2944 bp  464  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0054  23S ribosomal RNA segment  82.17 
 
 		 3298 bp  466  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.26274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0049  23S ribosomal RNA segment  82.17 
 
 		 3298 bp  466  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0030  23S ribosomal RNA segment  82.17 
 
 		 3298 bp  466  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00296414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0008  23S ribosomal RNA segment  82.17 
 
 		 3298 bp  466  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  82.18 
 
 		 2972 bp  460  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  81.73 
 
 		 2946 bp  456  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  81.73 
 
 		 2946 bp  456  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0004  23S ribosomal RNA  81.35 
 
 		 2928 bp  434  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  81.35 
 
 		 2927 bp  434  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  81.35 
 
 		 2927 bp  434  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2908 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2908 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2907 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2908 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  81.53 
 
 		 2908 bp  436  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  81.23 
 
 		 2933 bp  430  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  81.41 
 
 		 2908 bp  428  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  81.21 
 
 		 2935 bp  424  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  81.24 
 
 		 2927 bp  426  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  81.24 
 
 		 2927 bp  426  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  81.24 
 
 		 2927 bp  426  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0010  23S ribosomal RNA  81.24 
 
 		 2927 bp  426  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 2933 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 2933 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 2932 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 2933 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  81.11 
 
 		 2933 bp  422  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  81.29 
 
 		 2908 bp  420  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0054  23S ribosomal RNA  81.24 
 
 		 2969 bp  418  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0006  23S ribosomal RNA  81.24 
 
 		 2969 bp  418  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0035  23S ribosomal RNA  81.24 
 
 		 2969 bp  418  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0059  23S ribosomal RNA  81.85 
 
 		 2935 bp  418  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0882856  normal  0.887302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0037  23S ribosomal RNA  81.12 
 
 		 2927 bp  418  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  81 
 
 		 2933 bp  414  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  81.09 
 
 		 2933 bp  416  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  81.18 
 
 		 2911 bp  412  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0050  23S ribosomal RNA  81.73 
 
 		 2935 bp  410  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0045  23S ribosomal RNA  81.62 
 
 		 2976 bp  412  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.570059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0042  23S ribosomal RNA  81.62 
 
 		 2936 bp  412  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000650821 
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  81.18 
 
 		 2908 bp  412  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2909 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2926 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2912 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2911 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2911 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2911 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2911 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2908 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2908 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2908 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2908 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2908 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SG  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2908 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  81.06 
 
 		 2908 bp  404  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>