More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0041 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  89.75 
 
 
2922 bp  650    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  89.75 
 
 
2922 bp  650    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  89.75 
 
 
2922 bp  650    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  89.75 
 
 
2922 bp  650    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  89.75 
 
 
2922 bp  650    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  89.75 
 
 
2922 bp  650    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 
2909 bp  1100    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2909 bp  1104    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2909 bp  1104    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2926 bp  1104    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0016  23S ribosomal RNA  82.86 
 
 
2811 bp  708    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629398  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0048  23S ribosomal RNA  82.86 
 
 
2811 bp  708    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108917  normal 
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2851 bp  1104    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-7  23S ribosomal RNA  86.24 
 
 
2911 bp  1096    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-9  23S ribosomal RNA  86.24 
 
 
2911 bp  1096    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 
2912 bp  1106    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2912 bp  1104    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 
2911 bp  1106    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2912 bp  1104    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2911 bp  1104    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  86.4 
 
 
2911 bp  1112    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  86.33 
 
 
2913 bp  1098    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  86.4 
 
 
2911 bp  1112    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2912 bp  1104    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SG  23S ribosomal RNA  86.24 
 
 
2908 bp  1096    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SI  23S ribosomal RNA  86.24 
 
 
2908 bp  1096    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000225912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  86.32 
 
 
2908 bp  1104    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  86.88 
 
 
2972 bp  1132    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0023  23S ribosomal RNA  84.06 
 
 
3000 bp  728    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2999  23S ribosomal RNA  87.24 
 
 
2909 bp  981    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3002  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  989    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3005  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  989    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3008  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  989    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3011  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  989    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3014  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  989    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3017  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  989    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3020  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2907 bp  989    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r02  23S ribosomal RNA  87.44 
 
 
2908 bp  997    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r05  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  989    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r08  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  989    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r11  23S ribosomal RNA  87.24 
 
 
2908 bp  981    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r14  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  989    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r17  23S ribosomal RNA  87.24 
 
 
2908 bp  981    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r20  23S ribosomal RNA  87.24 
 
 
2908 bp  981    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r23  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  989    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r25  23S ribosomal RNA  87.24 
 
 
2907 bp  981    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r29  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2907 bp  989    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 
3529 bp  957    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 
3088 bp  957    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0021  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 
3260 bp  957    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  88.13 
 
 
2927 bp  1187    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0004  23S ribosomal RNA  88.08 
 
 
3592 bp  950    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0068  23S ribosomal RNA  87.08 
 
 
2908 bp  1092    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00625643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0059  23S ribosomal RNA  87.08 
 
 
2908 bp  1092    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0039  23S ribosomal RNA  87.08 
 
 
2908 bp  1092    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000978357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0056  23S ribosomal RNA  87.08 
 
 
2908 bp  1092    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000789359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0061  23S ribosomal RNA  84.74 
 
 
2556 bp  781    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0051  23S ribosomal RNA  84.74 
 
 
2556 bp  781    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0486976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0035  23S ribosomal RNA  84.74 
 
 
2556 bp  781    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.381491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>