More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0035 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0020  23S ribosomal RNA  84.89 
 
 
3062 bp  805    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000158535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0056  23S ribosomal RNA  85.51 
 
 
2908 bp  952    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000789359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0006  23S ribosomal RNA  99.83 
 
 
2969 bp  5846    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0087  23S ribosomal RNA  83.53 
 
 
3085 bp  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0310291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0039  23S ribosomal RNA  85.51 
 
 
2908 bp  952    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000978357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0082  23S ribosomal RNA  83.53 
 
 
3044 bp  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00960446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 
2944 bp  936    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  86.42 
 
 
2927 bp  1027    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0030  23S ribosomal RNA segment  86.38 
 
 
3298 bp  1061    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00296414  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0014  23S ribosomal RNA  83.53 
 
 
2913 bp  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0264747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0021  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 
2609 bp  870    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  86.26 
 
 
2933 bp  1003    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0041  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 
3027 bp  872    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0513089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  85.75 
 
 
2946 bp  955    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  86.34 
 
 
2927 bp  1019    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  86.42 
 
 
2927 bp  1027    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0031  23S ribosomal RNA  84.59 
 
 
3357 bp  767    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  86.34 
 
 
2932 bp  1011    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0067  23S ribosomal RNA  83.18 
 
 
2900 bp  718    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  90.27 
 
 
3129 bp  662    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0079  23S ribosomal RNA  84.98 
 
 
2913 bp  813    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0069  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 
2609 bp  870    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0004  23S ribosomal RNA  83.18 
 
 
2900 bp  718    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  86.26 
 
 
2933 bp  1003    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  86.17 
 
 
2933 bp  995    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 
2944 bp  936    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  86.42 
 
 
2927 bp  1027    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0004  23S ribosomal RNA  86.42 
 
 
2928 bp  1027    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  86.17 
 
 
2933 bp  995    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0032  23S ribosomal RNA  84.62 
 
 
2972 bp  747    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.922889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0064  23S ribosomal RNA  83.18 
 
 
2900 bp  718    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0037  23S ribosomal RNA  86.34 
 
 
2927 bp  1019    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0054  23S ribosomal RNA segment  86.38 
 
 
3298 bp  1061    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.26274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0049  23S ribosomal RNA segment  86.38 
 
 
3298 bp  1061    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  90.27 
 
 
3129 bp  662    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0008  23S ribosomal RNA  84.59 
 
 
3357 bp  767    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0009  23S ribosomal RNA  84.98 
 
 
2912 bp  813    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.363949  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  90.27 
 
 
3129 bp  662    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0064  23S ribosomal RNA  84.89 
 
 
2912 bp  805    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00853635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0071  23S ribosomal RNA  84.8 
 
 
2912 bp  797    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.19372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0020  23S ribosomal RNA  83.53 
 
 
3044 bp  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00975854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0009  23S ribosomal RNA  83.53 
 
 
2913 bp  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00195667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0038  23S ribosomal RNA  83.53 
 
 
2913 bp  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000518778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0058  23S ribosomal RNA  83.53 
 
 
2913 bp  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00925109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0041  23S ribosomal RNA  84.88 
 
 
2618 bp  862    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0588399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0002  23S ribosomal RNA  84.97 
 
 
2609 bp  870    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000051832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0035  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2969 bp  5886    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0054  23S ribosomal RNA  99.93 
 
 
2969 bp  5870    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  86.17 
 
 
2933 bp  995    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  86.17 
 
 
2935 bp  995    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  86.26 
 
 
2933 bp  1003    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  86.17 
 
 
2933 bp  995    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  85.65 
 
 
2946 bp  946    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  85.75 
 
 
2946 bp  955    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  86.17 
 
 
2933 bp  995    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0025  23S ribosomal RNA  86.12 
 
 
3027 bp  872    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0017  23S ribosomal RNA  83.35 
 
 
2900 bp  733    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  86.34 
 
 
2927 bp  1019    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0010  23S ribosomal RNA  86.34 
 
 
2927 bp  1019    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 
2943 bp  936    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0090  23S ribosomal RNA  83.35 
 
 
2900 bp  733    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.133955  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0059  23S ribosomal RNA  84.62 
 
 
2972 bp  747    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0139247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0084  23S ribosomal RNA  83.18 
 
 
2900 bp  718    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0759493  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0062  23S ribosomal RNA  84.62 
 
 
2972 bp  747    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0029  23S ribosomal RNA  83.18 
 
 
2900 bp  718    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0008  23S ribosomal RNA segment  86.38 
 
 
3298 bp  1061    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  86.81 
 
 
2972 bp  930    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0023  23S ribosomal RNA  83.78 
 
 
3000 bp  658    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  85.16 
 
 
3529 bp  801    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  85.16 
 
 
3088 bp  801    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0021  23S ribosomal RNA  85.16 
 
 
3260 bp  801    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0068  23S ribosomal RNA  85.51 
 
 
2908 bp  952    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00625643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0059  23S ribosomal RNA  85.51 
 
 
2908 bp  952    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00107341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  90.27 
 
 
3129 bp  662    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0026  23S ribosomal RNA  83.53 
 
 
3044 bp  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000193882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2999  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2909 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3002  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3005  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3008  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3011  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3014  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3017  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3020  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2907 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r02  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r05  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r08  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r11  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r14  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r20  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r23  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2908 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r25  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2907 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r29  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 
2907 bp  624  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r17  23S ribosomal RNA  89.22 
 
 
2908 bp  617  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  89.2 
 
 
2909 bp  605  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  89.2 
 
 
2908 bp  605  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  89.2 
 
 
2908 bp  605  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  89.2 
 
 
2908 bp  605  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  89.2 
 
 
2908 bp  605  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  89.2 
 
 
2908 bp  605  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  89.2 
 
 
2908 bp  605  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>