More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0030 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0043  23S ribosomal RNA  85.87 
 
 
2926 bp  892    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0030  23S ribosomal RNA  85.78 
 
 
2926 bp  884    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0025  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2942 bp  5832    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0014  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2942 bp  5832    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648594  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0030  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2942 bp  5832    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  87.77 
 
 
2972 bp  523  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 
2908 bp  513  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0010  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2909 bp  505  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0263199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0185  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2909 bp  505  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000705814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0303  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2909 bp  505  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2909 bp  505  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2909 bp  505  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2909 bp  505  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2926 bp  505  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0331  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2909 bp  505  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0105  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2909 bp  505  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0325  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2909 bp  505  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0212799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2851 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2912 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2912 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2912 bp  505  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2911 bp  505  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2912 bp  505  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2908 bp  505  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0034  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2909 bp  505  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2999  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2909 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3002  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3005  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3008  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3011  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3014  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3017  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3020  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2907 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r02  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r05  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r08  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r11  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r14  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r20  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r23  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2908 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r25  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2907 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r29  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 
2907 bp  504  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0092  23S ribosomal RNA  87.48 
 
 
2909 bp  505  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0130944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>