More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0030 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0014  23S ribosomal RNA  85.78 
 
 		 2942 bp  884    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648594  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0030  23S ribosomal RNA  85.78 
 
 		 2942 bp  884    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0043  23S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 2926 bp  5785    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0030  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2926 bp  5800    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0025  23S ribosomal RNA  85.78 
 
 		 2942 bp  884    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0031  23S ribosomal RNA  84.8 
 
 		 3357 bp  323  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0008  23S ribosomal RNA  84.8 
 
 		 3357 bp  323  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0038  23S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 2913 bp  299  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000518778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0087  23S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 3085 bp  299  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0310291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0058  23S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 2913 bp  299  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00925109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0026  23S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 3044 bp  299  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000193882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0082  23S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 3044 bp  299  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00960446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0020  23S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 3044 bp  299  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00975854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0009  23S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 2913 bp  299  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00195667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0014  23S ribosomal RNA  84.4 
 
 		 2913 bp  299  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0264747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 2908 bp  291  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2907 bp  283  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2907 bp  283  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2907 bp  283  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2907 bp  283  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2907 bp  283  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2909 bp  283  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2909 bp  283  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2909 bp  283  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2926 bp  283  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2851 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-7  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2912 bp  283  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2912 bp  283  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2912 bp  283  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2911 bp  283  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2912 bp  283  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0039  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 3105 bp  283  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522575  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0047  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 3105 bp  283  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.137502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2907 bp  283  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2907 bp  283  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0023  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 3109 bp  283  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0016  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 3109 bp  283  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2907 bp  283  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0029  23S ribosomal RNA  83.04 
 
 		 3109 bp  283  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655069  decreased coverage  0.000196644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0010  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2909 bp  283  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0263199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2908 bp  283  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0105  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2909 bp  283  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0034  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2909 bp  283  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0092  23S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 2909 bp  283  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0130944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>