63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1015 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1015  ATP phosphoribosyltransferase, regulatory subunit  100 
 
 		 261 aa  523  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  23.76 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.98 
 
 		 392 aa  55.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.4 
 
 		 420 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  24.6 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1480  tRNA synthetase class II (G H P and S)  27.8 
 
 		 393 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.05 
 
 		 420 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.7 
 
 		 420 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.7 
 
 		 420 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.34 
 
 		 420 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.34 
 
 		 420 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.47 
 
 		 420 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.34 
 
 		 420 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.75 
 
 		 440 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  23.59 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.75 
 
 		 440 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  23.41 
 
 		 383 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.05 
 
 		 438 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  21.68 
 
 		 554 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  22.4 
 
 		 417 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2077  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.7 
 
 		 383 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  23.47 
 
 		 427 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2834  histidyl-tRNA synthetase 2  22.68 
 
 		 368 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  19.92 
 
 		 394 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.99 
 
 		 420 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.34 
 
 		 420 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4942  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.03 
 
 		 395 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  19.72 
 
 		 538 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  22.22 
 
 		 346 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0902  histidyl-tRNA synthetase 2  21.05 
 
 		 395 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.188473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2173  tRNA synthetase class II (G H P and S)  23.85 
 
 		 375 aa  45.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.05 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.10851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3252  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  20.93 
 
 		 429 aa  45.4  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  21.39 
 
 		 421 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  21.3 
 
 		 409 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  24.73 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1100  histidyl-tRNA synthetase 2  21.17 
 
 		 382 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.25 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  21.28 
 
 		 421 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.25 
 
 		 418 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0228  tRNA synthetase class II (G H P and S)  20.21 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  19.89 
 
 		 392 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1940  tRNA synthetase class II (G H P and S)  20.4 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0886  histidyl-tRNA synthetase 2  22.35 
 
 		 404 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151754  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1119  tRNA synthetase class II (G H P and S)  21.52 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0668302  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4890  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  20.66 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0527  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  19.85 
 
 		 395 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558326  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2097  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.15 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1180  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  20.8 
 
 		 382 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.869352  normal  0.414984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4766  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  20.66 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3163  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  22.99 
 
 		 382 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65250  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.43 
 
 		 394 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3380  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.43 
 
 		 385 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  20 
 
 		 436 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2858  tRNA synthetase class II (G H P and S)  22.97 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0442  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.05 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  22.64 
 
 		 421 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  22.42 
 
 		 418 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  20.58 
 
 		 401 aa  43.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000998206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0576  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  19.85 
 
 		 395 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 		 426 aa  42  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  20.94 
 
 		 438 aa  42  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  21.09 
 
 		 389 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>