34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2170 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  38.41 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  39.29 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  39.29 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  39.72 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  41.11 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  34.84 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  36.17 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  35.42 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  40.16 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  35.66 
 
 		 271 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  29.3 
 
 		 469 aa  63.9  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  36.91 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  31.14 
 
 		 309 aa  62  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  34.01 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  32.52 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.790547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0151  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  36.73 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  0.0000000326154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0504  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0150  hypothetical protein  34.87 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323748  normal  0.0553337 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0473  hypothetical protein  38.27 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0199581  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1684  hypothetical protein  29.93 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  35.21 
 
 		 263 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18170  predicted protein  34.85 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579095  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1557  hypothetical protein  29.5 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.875032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0529  glutaredoxin  37.32 
 
 		 243 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.566915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1836  hypothetical protein  29.5 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.277804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0297  hypothetical protein  38.33 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1664  hypothetical protein  38 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2581  hypothetical protein  35.35 
 
 		 150 aa  43.9  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453337 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1071  hypothetical protein  44.44 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  36 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1971  glutaredoxin  38.46 
 
 		 253 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>