19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_18170 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_18170  predicted protein  100 
 
 
166 aa  328  3e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579095  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  35.95 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  33.57 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  36.18 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  36.18 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  33.85 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  35.17 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  34.56 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  38.41 
 
 
271 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  39.56 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  37.25 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  28.48 
 
 
150 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  36.28 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  34.46 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0473  hypothetical protein  32.79 
 
 
146 aa  45.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0199581  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  29.53 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  0.0000000326154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  35.51 
 
 
263 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  30.5 
 
 
160 aa  41.2  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  35.4 
 
 
309 aa  40.8  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>