28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1544 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  303  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0150  hypothetical protein  39.38 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323748  normal  0.0553337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  31.97 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  36.09 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  32.61 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  33.87 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  33.1 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  34.01 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  36.17 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  44.3 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  31.08 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  31.08 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  38.3 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  35.33 
 
 
263 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  37.01 
 
 
271 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01869  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  47.8  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1971  glutaredoxin  45.88 
 
 
253 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000574  hypothetical protein  31.78 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0151  hypothetical protein  31.39 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  31.01 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.790547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0529  glutaredoxin  37.5 
 
 
243 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.566915 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05308  hypothetical protein  32.31 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3352  hypothetical protein  43.48 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0749  hypothetical protein  40.38 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.110319  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  27.39 
 
 
469 aa  42  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  33.96 
 
 
309 aa  41.6  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18170  predicted protein  30.5 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579095  normal  0.433034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>