15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0473 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0473  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  266  8e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0199581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  42.54 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  41.35 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  39.39 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  47.95 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  36.17 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  34.56 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  35.51 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  38.55 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  40.82 
 
 
263 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18170  predicted protein  32.79 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579095  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  37.04 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  41.11 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>