19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0184 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  286  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2581  hypothetical protein  63.76 
 
 		 150 aa  170  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1664  hypothetical protein  64.86 
 
 		 150 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0297  hypothetical protein  64.19 
 
 		 150 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  60.14 
 
 		 152 aa  166  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  0.0000000326154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0504  hypothetical protein  54.05 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  36.91 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  31.58 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  32.24 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  31.72 
 
 		 271 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  26.35 
 
 		 469 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3352  hypothetical protein  32.85 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18170  predicted protein  27.54 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579095  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  32.39 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.790547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  31.76 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0151  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  31.01 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0150  hypothetical protein  27.98 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323748  normal  0.0553337 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  28.93 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>