22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0593 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  291  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  54 
 
 
158 aa  157  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  37.93 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  42.45 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  43.28 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  41.11 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  37.59 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0473  hypothetical protein  41.82 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0199581  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  37.88 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  37.88 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  32 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  40.78 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  32.3 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  31.69 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0749  hypothetical protein  32.46 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18170  predicted protein  41.11 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579095  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1971  glutaredoxin  48.61 
 
 
253 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0529  glutaredoxin  38.21 
 
 
243 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.566915 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  26.47 
 
 
469 aa  47  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  0.0000000326154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1071  hypothetical protein  34.52 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0775685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>