15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0151 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0151  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  294  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  32.35 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  34.01 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  32.12 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  32.12 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  32.37 
 
 
263 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  33.1 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  31.39 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  32.39 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1371  hypothetical protein  31.54 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01869  hypothetical protein  43.66 
 
 
140 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1664  hypothetical protein  32.32 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0297  hypothetical protein  32.32 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  34.31 
 
 
271 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>