13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1071 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1071  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  214  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775685 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0749  hypothetical protein  84.38 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.110319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  42.7 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  42.05 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  42.31 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  37.36 
 
 		 271 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  43.18 
 
 		 263 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  43.86 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  38.1 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  44.44 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  36.78 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0529  glutaredoxin  44.64 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.566915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>