20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0529 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0529  glutaredoxin  100 
 
 
243 aa  474  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.566915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  40.08 
 
 
263 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1971  glutaredoxin  41.41 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  42.96 
 
 
153 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  36.4 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  39.01 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  39.69 
 
 
158 aa  72  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  42.75 
 
 
152 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  37.78 
 
 
152 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  40.85 
 
 
155 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  36.17 
 
 
160 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  32.65 
 
 
469 aa  56.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  38.1 
 
 
153 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0150  hypothetical protein  35.51 
 
 
158 aa  55.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323748  normal  0.0553337 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  42.22 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  37.93 
 
 
86 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  31.58 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  31.58 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1371  hypothetical protein  31.06 
 
 
136 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000574  hypothetical protein  33.78 
 
 
147 aa  42  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>