45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1971 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1971  glutaredoxin  100 
 
 		 253 aa  489  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0529  glutaredoxin  41.42 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.566915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  39.75 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  37.44 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  39.38 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  35.86 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  37.32 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  38.81 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  37.09 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  41.94 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  46.91 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  36.55 
 
 		 150 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  32.17 
 
 		 151 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  32.17 
 
 		 151 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05308  hypothetical protein  36.15 
 
 		 141 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  34.78 
 
 		 155 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.790547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1664  hypothetical protein  41.58 
 
 		 150 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0297  hypothetical protein  41.58 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2581  hypothetical protein  41.41 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  40.35 
 
 		 85 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  46.15 
 
 		 87 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  46.15 
 
 		 87 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2149  glutaredoxin-like protein  31.4 
 
 		 111 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.907449 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000574  hypothetical protein  35.66 
 
 		 147 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561088  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01869  hypothetical protein  34.13 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0123  glutaredoxin-like protein  32.14 
 
 		 110 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1939  glutaredoxin-like protein  30.23 
 
 		 111 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0865  glutaredoxin-like protein  24.42 
 
 		 110 aa  44.3  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.353884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0151  hypothetical protein  31.94 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2391  glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 		 110 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0835  glutaredoxin-related protein  29.41 
 
 		 130 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0827  glutaredoxin-related protein  29.41 
 
 		 130 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0606  hypothetical protein  27.7 
 
 		 146 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  35.77 
 
 		 152 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  0.0000000326154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1418  glutaredoxin-like protein  32.79 
 
 		 107 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1661  glutaredoxin-like protein  31.15 
 
 		 107 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.147009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  31.48 
 
 		 112 aa  43.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1273  glutaredoxin-like protein  29.89 
 
 		 111 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.909876  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0302  glutaredoxin-related protein  25.3 
 
 		 110 aa  42.7  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.354475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0473  hypothetical protein  41.56 
 
 		 146 aa  42.4  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0199581  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18170  predicted protein  33.09 
 
 		 166 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579095  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  31.33 
 
 		 112 aa  42.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1508  glutaredoxin-like protein  30.12 
 
 		 111 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>