13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0606 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0606  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1949  hypothetical protein  37.06 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0204767  normal  0.0217972 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05308  hypothetical protein  34.03 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000574  hypothetical protein  34.69 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561088  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1371  hypothetical protein  33.11 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0932  hypothetical protein  33.85 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  36.15 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  34.78 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  34.68 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  34.31 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  30.43 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  30.33 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>