More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1153 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1153  asparaginase/glutaminase  100 
 
 		 336 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  51.46 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  51.46 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  43.31 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1837  asparaginase/glutaminase  39.14 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  34.19 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2187  asparaginase/glutaminase  38.44 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  33.55 
 
 		 327 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  32.59 
 
 		 327 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  35.28 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  33.23 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  33.88 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4244  asparaginase/glutaminase  41.42 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1297  asparaginase/glutaminase  36.81 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22840  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  41.1 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  37.79 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  31.87 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  35.39 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0782  asparaginase  31.86 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0447  Asparaginase/glutaminase  34.43 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  34.06 
 
 		 356 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  34.06 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  34.06 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39060  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  43.72 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  33.75 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1566  asparaginase/glutaminase  31.64 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646872  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1535  asparaginase/glutaminase  31.64 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0094  asparaginase/glutaminase  40 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.875352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  37.26 
 
 		 346 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  32.79 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  31.52 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1046  L-asparaginase  28.52 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  36.31 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  37.3 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  29.1 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  30.79 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  30.03 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  30.03 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  30.03 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  30.34 
 
 		 348 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1946  asparaginase/glutaminase  36.91 
 
 		 352 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0515464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  34.08 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  33.76 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1590  L-asparaginase  30.65 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36341e-23 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  35.83 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  36.28 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  37.97 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  35.62 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2741  asparaginase  35.24 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2021  Asparaginase/glutaminase  37.88 
 
 		 362 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  36.36 
 
 		 340 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  36.68 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  29.23 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  34.49 
 
 		 367 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  33.12 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3399  asparaginase/glutaminase  37.38 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  29.85 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  36.68 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  35.96 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0779  L-asparaginase  31.48 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  36.68 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00150  L-asparaginase type II family protein  35.09 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.589872 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  32.1 
 
 		 348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1551  L-asparaginase  29.5 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000310324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3794  L-asparaginase  29.12 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538157  hitchhiker  0.000000163476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2999  Asparaginase/glutaminase  38.01 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  28.92 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1679  asparaginase family protein  30.72 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0304633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  31.43 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2081  asparaginase  34.3 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.438459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0058  Asparaginase/glutaminase  43.41 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0860  Asparaginase/glutaminase  36.94 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.832508  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  34.88 
 
 		 330 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3001  asparaginase/glutaminase  36.33 
 
 		 350 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  29.41 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  29.41 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  32.17 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  29.41 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0900  asparaginase/glutaminase  36.62 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1550  Asparaginase  37.11 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2327  Asparaginase/glutaminase  44.33 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03600  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  39.02 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1690  L-asparaginase  32.85 
 
 		 307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.758697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2631  Asparaginase/glutaminase  42.44 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2953  asparaginase  34.02 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3641  asparaginase/glutaminase  38.28 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  33.33 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1657  L-asparaginase  28.93 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000496167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  31.06 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  33.44 
 
 		 347 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  28.62 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2309  asparaginase  36.43 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00324768  normal  0.172792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3220  asparaginase/glutaminase  36.33 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2559  asparaginase/glutaminase  35.64 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0847476  normal  0.0141583 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1865  asparaginase  36.4 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2272  Asparaginase/glutaminase  36.42 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  31.58 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  31.58 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0827  Asparaginase/glutaminase  36 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3114  asparaginase  36.12 
 
 		 309 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>