More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1306 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  100 
 
 		 367 aa  728    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  86.32 
 
 		 330 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  86.63 
 
 		 330 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  52.77 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1980  asparaginase  57.06 
 
 		 333 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  54.49 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2007  L-asparaginase, type II  58.39 
 
 		 378 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.354174  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  54.82 
 
 		 340 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  56.78 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  54.9 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  55.99 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  54.14 
 
 		 340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  55.99 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  55.99 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  55.99 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  55.99 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  55.99 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  55.99 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  53.78 
 
 		 340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  53.78 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  53.78 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  54.22 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  51.19 
 
 		 338 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  42.34 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2924  L-asparaginase, type II  44.98 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  43.63 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  40.59 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  44.19 
 
 		 348 aa  249  7e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  44.37 
 
 		 348 aa  249  8e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  43.23 
 
 		 348 aa  248  9e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  43.23 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  39.94 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  42.9 
 
 		 346 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3114  L-asparaginase, type II  44.01 
 
 		 348 aa  243  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  42.33 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  42.33 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  42.02 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  42.02 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  39.88 
 
 		 338 aa  238  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3912  L-asparaginase  41.72 
 
 		 347 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3973  L-asparaginase  41.72 
 
 		 347 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3792  L-asparaginase  41.72 
 
 		 347 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0751735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3870  L-asparaginase  41.72 
 
 		 347 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3804  L-asparaginase  41.72 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1919  asparaginase  46.08 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2132  asparaginase  48.21 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  42.37 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  44.01 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  44.01 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  38.55 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  44.01 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  40.6 
 
 		 348 aa  230  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  43.71 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  43.71 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  43.71 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  43.71 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2449  asparaginase  45.4 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  43.71 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  43.71 
 
 		 348 aa  229  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  39.77 
 
 		 348 aa  229  7e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  43.41 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  42.53 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4896  asparaginase  47.44 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.970044  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1550  Asparaginase  48.55 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2953  asparaginase  45.43 
 
 		 316 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  41.92 
 
 		 348 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2309  asparaginase  47.91 
 
 		 323 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00324768  normal  0.172792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2993  asparaginase  43.28 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.740991  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  41.48 
 
 		 352 aa  216  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  41.89 
 
 		 345 aa  215  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  41.89 
 
 		 345 aa  215  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0442  L-asparaginases, type II  41.44 
 
 		 379 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2637  Asparaginase  46.13 
 
 		 329 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0564  L-asparaginase, type II  40.96 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  41.99 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  40.48 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3136  L-asparaginase, type II  40.06 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3863  L-asparaginases, type II  40.06 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.354581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1812  L-asparaginase, type II  37.58 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  41.32 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  41.32 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  41.32 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  41.32 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  41.32 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  42.31 
 
 		 339 aa  205  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4228  L-asparaginase, type II  37.76 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4206  L-asparaginases, type II  39.7 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1583  asparaginase  37.34 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000246256  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4748  L-asparaginase, type II  38.86 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3427  L-asparaginase, type II  38.86 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2559  asparaginase/glutaminase  44.62 
 
 		 325 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0847476  normal  0.0141583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5042  L-asparaginase, type II  40.48 
 
 		 369 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5349  L-asparaginase, type II  40.18 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3566  asparaginase  44.2 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188072  hitchhiker  0.00798524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4182  L-asparaginases, type II  39.1 
 
 		 365 aa  199  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428323  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2081  asparaginase  42.9 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.438459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2689  L-asparaginase, type II  41.75 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.373089 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00300  asparaginase, aspartic hydroxamate res. (Eurofung)  36.48 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0205708  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  37.26 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00150  L-asparaginase type II family protein  35.44 
 
 		 328 aa  190  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.589872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>