More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4244 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4244  asparaginase/glutaminase  100 
 
 		 327 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3399  asparaginase/glutaminase  59.34 
 
 		 312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3641  asparaginase/glutaminase  45.12 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3114  asparaginase  46.13 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2631  Asparaginase/glutaminase  48.22 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3094  asparaginase/glutaminase  45.79 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3154  asparaginase/glutaminase  45.79 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2999  Asparaginase/glutaminase  42.33 
 
 		 328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  37.69 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  37.69 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0058  Asparaginase/glutaminase  47.1 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22840  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  40.06 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  38.59 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2772  asparaginase/glutaminase  44.11 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0462743  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  33.93 
 
 		 355 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  34.78 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11571  L-aparaginase ansA  38.61 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  31.21 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1153  asparaginase/glutaminase  39.67 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39060  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  39.48 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  34.39 
 
 		 355 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  36.88 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1837  asparaginase/glutaminase  32.71 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  33.13 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  34.08 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2187  asparaginase/glutaminase  33.77 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  30.65 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  30.43 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  30.43 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  29.6 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1297  asparaginase/glutaminase  33.11 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  33.04 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  26.07 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  31.64 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  31.82 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  34.62 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2081  asparaginase  33.97 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.438459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  34.32 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  33.43 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0192  Asparaginase/glutaminase  35.02 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  32.92 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  33.73 
 
 		 365 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  33.73 
 
 		 365 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  32.06 
 
 		 367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  28.49 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  32.18 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2327  Asparaginase/glutaminase  40 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  33.43 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  31.86 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  27.91 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0094  asparaginase/glutaminase  34.37 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.875352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0447  Asparaginase/glutaminase  28.66 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2021  Asparaginase/glutaminase  34.32 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  32.84 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  28.13 
 
 		 338 aa  109  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1566  asparaginase/glutaminase  27.64 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646872  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1535  asparaginase/glutaminase  27.64 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1046  L-asparaginase  25.78 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101218  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1946  asparaginase/glutaminase  33.33 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0515464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1865  asparaginase  34.93 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  28.78 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  28.78 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  33.24 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  33.04 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  33.04 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  33.04 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  33.04 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  33.04 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  33.04 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  27.59 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  27.59 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3427  L-asparaginase, type II  30 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1709  anthranilate synthase component II  26.46 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0779  L-asparaginase  25.53 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  26.96 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2953  asparaginase  30.88 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  29.15 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  27.27 
 
 		 324 aa  99.4  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3001  asparaginase/glutaminase  33.12 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  29 
 
 		 356 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  27.79 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  29.34 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  29.34 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1009  L-asparaginase II  28 
 
 		 325 aa  95.9  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0200439  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2309  asparaginase  32.99 
 
 		 323 aa  95.9  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00324768  normal  0.172792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  27.27 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3220  asparaginase/glutaminase  32.11 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  27.27 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  27.27 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  29.04 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2007  L-asparaginase, type II  33.01 
 
 		 378 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.354174  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2924  L-asparaginase, type II  29.04 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3136  L-asparaginase, type II  29.09 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3863  L-asparaginases, type II  29.09 
 
 		 366 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.354581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0900  asparaginase/glutaminase  31.91 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  28.01 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  28.4 
 
 		 348 aa  93.2  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  27.84 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1550  Asparaginase  32.99 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  26.14 
 
 		 418 aa  92.4  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>