More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1046 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1046  L-asparaginase  100 
 
 
322 aa  660    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101218  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1535  asparaginase/glutaminase  70.09 
 
 
322 aa  475  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1566  asparaginase/glutaminase  70.09 
 
 
322 aa  475  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  52.63 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  52.63 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0782  asparaginase  50.16 
 
 
320 aa  325  4.0000000000000003e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  51.54 
 
 
324 aa  325  7e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  52.94 
 
 
324 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  52.94 
 
 
324 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  52.94 
 
 
324 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  52.01 
 
 
324 aa  321  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1679  asparaginase family protein  46.91 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0304633  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0779  L-asparaginase  47.71 
 
 
322 aa  310  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1590  L-asparaginase  51.78 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36341e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3794  L-asparaginase  52.1 
 
 
310 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538157  hitchhiker  0.000000163476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1551  L-asparaginase  51.46 
 
 
310 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000310324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1657  L-asparaginase  52.1 
 
 
310 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000496167  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1690  L-asparaginase  46.28 
 
 
307 aa  290  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.758697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  43.81 
 
 
349 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  36.76 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  38.08 
 
 
334 aa  229  4e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  38.34 
 
 
327 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  38.04 
 
 
327 aa  225  9e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2187  asparaginase/glutaminase  34.88 
 
 
320 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560936  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  32.2 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1297  asparaginase/glutaminase  33.64 
 
 
320 aa  198  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1837  asparaginase/glutaminase  36.06 
 
 
321 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  34.45 
 
 
354 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  34.29 
 
 
330 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  33.85 
 
 
332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  30.09 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  33.94 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  33.23 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  29.6 
 
 
328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0094  asparaginase/glutaminase  34.43 
 
 
321 aa  182  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.875352  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3220  asparaginase/glutaminase  36.6 
 
 
350 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3001  asparaginase/glutaminase  35.9 
 
 
350 aa  175  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1946  asparaginase/glutaminase  34.75 
 
 
352 aa  175  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0515464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2741  asparaginase  37.01 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0900  asparaginase/glutaminase  31.9 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0192  Asparaginase/glutaminase  32.41 
 
 
328 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  30.87 
 
 
355 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0860  Asparaginase/glutaminase  31.9 
 
 
327 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.832508  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  30.55 
 
 
355 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  29.45 
 
 
355 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0827  Asparaginase/glutaminase  31.33 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2981  Asparaginase  31.27 
 
 
327 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  37.9 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0447  Asparaginase/glutaminase  30.72 
 
 
323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3973  L-asparaginase  32.74 
 
 
347 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3912  L-asparaginase  32.74 
 
 
347 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278506  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3792  L-asparaginase  32.74 
 
 
347 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0751735  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2924  L-asparaginase, type II  31.83 
 
 
348 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4951  L-asparaginase, type II  31.91 
 
 
323 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  31.64 
 
 
348 aa  159  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3870  L-asparaginase  32.74 
 
 
347 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  35.92 
 
 
345 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  35.92 
 
 
345 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  35.92 
 
 
345 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3804  L-asparaginase  32.74 
 
 
347 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2272  Asparaginase/glutaminase  31.73 
 
 
367 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  32.53 
 
 
356 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37190  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  32.21 
 
 
328 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1262  putative L-asparaginase  32.34 
 
 
329 aa  155  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  30.28 
 
 
349 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  32.53 
 
 
352 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  32.53 
 
 
352 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  32.53 
 
 
338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  32.53 
 
 
352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  32.52 
 
 
348 aa  153  5e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  35.2 
 
 
348 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  30.84 
 
 
355 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  32.52 
 
 
338 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3114  L-asparaginase, type II  29.88 
 
 
348 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1709  anthranilate synthase component II  29.28 
 
 
325 aa  150  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  31.6 
 
 
354 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  33.11 
 
 
348 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.881329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  28.57 
 
 
340 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  34.02 
 
 
348 aa  149  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  32.79 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  32.79 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  32.79 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  32.79 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  32.14 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  32.79 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  33.11 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1194  asparaginase/glutaminase  28.66 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  32.79 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  32.46 
 
 
348 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  32.46 
 
 
348 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  28.7 
 
 
347 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1009  L-asparaginase II  27.91 
 
 
325 aa  146  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0200439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39060  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  29.78 
 
 
337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  28.57 
 
 
340 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2021  Asparaginase/glutaminase  31.76 
 
 
362 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  28.27 
 
 
340 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  31.85 
 
 
348 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1160  asparaginase/glutaminase  28.66 
 
 
329 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511952  normal  0.0114275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  30.32 
 
 
338 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  28.27 
 
 
365 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>