More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2327 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2327  Asparaginase/glutaminase  100 
 
 
320 aa  589  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39060  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  52.77 
 
 
337 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  48.23 
 
 
330 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22840  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  47 
 
 
324 aa  205  7e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  41.74 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  41.74 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  38.14 
 
 
327 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1837  asparaginase/glutaminase  39.48 
 
 
321 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  32.28 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  41.25 
 
 
328 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  36.18 
 
 
334 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  34.71 
 
 
338 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  34.08 
 
 
349 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3641  asparaginase/glutaminase  45.31 
 
 
300 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2187  asparaginase/glutaminase  38.17 
 
 
320 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560936  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1946  asparaginase/glutaminase  40.63 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0515464 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1046  L-asparaginase  32.37 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101218  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0058  Asparaginase/glutaminase  49.82 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149334  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3114  asparaginase  48.49 
 
 
309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355227  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0782  asparaginase  33.01 
 
 
320 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  38.71 
 
 
355 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  38.39 
 
 
355 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0779  L-asparaginase  31.83 
 
 
322 aa  158  9e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  38.71 
 
 
355 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0447  Asparaginase/glutaminase  34.32 
 
 
323 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2999  Asparaginase/glutaminase  44.48 
 
 
328 aa  156  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  34.88 
 
 
348 aa  155  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  38.17 
 
 
354 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2631  Asparaginase/glutaminase  47.6 
 
 
315 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3220  asparaginase/glutaminase  38.54 
 
 
350 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1297  asparaginase/glutaminase  36.02 
 
 
320 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3001  asparaginase/glutaminase  39.01 
 
 
350 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1679  asparaginase family protein  33.76 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0304633  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3094  asparaginase/glutaminase  48 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3154  asparaginase/glutaminase  48 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1535  asparaginase/glutaminase  33.44 
 
 
322 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1566  asparaginase/glutaminase  33.44 
 
 
322 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646872  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3399  asparaginase/glutaminase  38.24 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0192  Asparaginase/glutaminase  39.87 
 
 
328 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  29.34 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2272  Asparaginase/glutaminase  38.46 
 
 
367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  32.72 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  29.65 
 
 
327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  32.72 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  36.57 
 
 
352 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2021  Asparaginase/glutaminase  37.35 
 
 
362 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1690  L-asparaginase  35.42 
 
 
307 aa  145  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.758697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0827  Asparaginase/glutaminase  42 
 
 
327 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  33.23 
 
 
347 aa  144  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4244  asparaginase/glutaminase  42.02 
 
 
327 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2772  asparaginase/glutaminase  44 
 
 
299 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0462743  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2741  asparaginase  37.42 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1153  asparaginase/glutaminase  42.86 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  33.44 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  37.7 
 
 
340 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11571  L-aparaginase ansA  45.55 
 
 
326 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  33.87 
 
 
348 aa  138  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  33.12 
 
 
324 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  33.12 
 
 
324 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  36.53 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  37.38 
 
 
347 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  32 
 
 
331 aa  136  5e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  37.74 
 
 
367 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  37.27 
 
 
340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  37.06 
 
 
340 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  37.54 
 
 
340 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  31.63 
 
 
324 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  32.8 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  35.78 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  37.54 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  37.22 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  37.54 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  37.39 
 
 
345 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2132  asparaginase  37.74 
 
 
330 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0900  asparaginase/glutaminase  38.76 
 
 
327 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  31.89 
 
 
356 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  37.39 
 
 
345 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  31.89 
 
 
352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  31.89 
 
 
352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37190  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  40.19 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  31.89 
 
 
352 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  36.62 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  37.39 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  35.95 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0860  Asparaginase/glutaminase  37.79 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.832508  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  31.31 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  33.12 
 
 
324 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  33.12 
 
 
324 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  36.83 
 
 
330 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  33.12 
 
 
324 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1590  L-asparaginase  33.09 
 
 
310 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36341e-23 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  37.38 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  37.38 
 
 
396 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  37.38 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  37.38 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  37.38 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  37.38 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  37.38 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0337  L-asparaginase  38.44 
 
 
322 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2449  asparaginase  37.34 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>