293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2741 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2741  asparaginase  100 
 
 
329 aa  645    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0860  Asparaginase/glutaminase  52.47 
 
 
327 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.832508  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0900  asparaginase/glutaminase  52.47 
 
 
327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1946  asparaginase/glutaminase  52.29 
 
 
352 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0515464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0827  Asparaginase/glutaminase  53.05 
 
 
327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3220  asparaginase/glutaminase  52.76 
 
 
350 aa  288  9e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3001  asparaginase/glutaminase  51.4 
 
 
350 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1262  putative L-asparaginase  39.33 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1178  asparaginase/glutaminase  44.44 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228392  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2981  Asparaginase  42.86 
 
 
327 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  40.55 
 
 
349 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1194  asparaginase/glutaminase  43.08 
 
 
329 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1962  asparaginase family protein  44.34 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255532  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1888  asparaginase family protein  44.04 
 
 
329 aa  220  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000189998  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37190  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  43.84 
 
 
328 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  38.77 
 
 
338 aa  215  7e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1009  L-asparaginase II  38.89 
 
 
325 aa  215  8e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0200439  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1709  anthranilate synthase component II  37.35 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1160  asparaginase/glutaminase  43.71 
 
 
329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511952  normal  0.0114275 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  37.88 
 
 
334 aa  202  5e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4252  asparaginase/glutaminase  43.08 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  42.73 
 
 
330 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  35.8 
 
 
324 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  36.25 
 
 
327 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  36.11 
 
 
324 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  36.11 
 
 
324 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  35.65 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1046  L-asparaginase  35.05 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101218  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1535  asparaginase/glutaminase  34.24 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1566  asparaginase/glutaminase  34.24 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2187  asparaginase/glutaminase  36.73 
 
 
320 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560936  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0192  Asparaginase/glutaminase  39.75 
 
 
328 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  36.11 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  35.49 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  36.11 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  36.11 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1590  L-asparaginase  36.86 
 
 
310 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36341e-23 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  34.57 
 
 
352 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1551  L-asparaginase  36.52 
 
 
310 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000310324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3794  L-asparaginase  36.52 
 
 
310 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538157  hitchhiker  0.000000163476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  35.03 
 
 
327 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0782  asparaginase  35.6 
 
 
320 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  38.02 
 
 
330 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  37.88 
 
 
340 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1837  asparaginase/glutaminase  34.57 
 
 
321 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1657  L-asparaginase  36.52 
 
 
310 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000496167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0779  L-asparaginase  33.94 
 
 
322 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  34.15 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  36.97 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  38.02 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  37.27 
 
 
340 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  37.27 
 
 
365 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  37.27 
 
 
365 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  37.27 
 
 
340 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  32.5 
 
 
327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  37.05 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  34.04 
 
 
355 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  35.91 
 
 
328 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1297  asparaginase/glutaminase  33.33 
 
 
320 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  33.84 
 
 
348 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  37.69 
 
 
367 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  33.33 
 
 
348 aa  160  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  33.03 
 
 
355 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1679  asparaginase family protein  32.62 
 
 
320 aa  159  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0304633  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  32.43 
 
 
338 aa  159  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  33.13 
 
 
344 aa  158  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2272  Asparaginase/glutaminase  38.64 
 
 
367 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  34.51 
 
 
354 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  33.23 
 
 
347 aa  157  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  37.57 
 
 
347 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  31.74 
 
 
354 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  33.23 
 
 
348 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  33.53 
 
 
348 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  34.85 
 
 
345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  34.85 
 
 
345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  34.44 
 
 
348 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  34.74 
 
 
345 aa  153  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  34.11 
 
 
348 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.881329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  34.11 
 
 
348 aa  152  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  31.74 
 
 
338 aa  152  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  34.11 
 
 
348 aa  152  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  34.11 
 
 
348 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  34.11 
 
 
348 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  31.82 
 
 
349 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  34.11 
 
 
348 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  33.44 
 
 
348 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  34.11 
 
 
348 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  34.11 
 
 
348 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  34.11 
 
 
348 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4951  L-asparaginase, type II  35.47 
 
 
323 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  33.44 
 
 
348 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  33.44 
 
 
348 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0447  Asparaginase/glutaminase  33.96 
 
 
323 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  34.02 
 
 
348 aa  149  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  33.44 
 
 
348 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  33.44 
 
 
348 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  33.44 
 
 
348 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  36.19 
 
 
332 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  35.35 
 
 
355 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  36.22 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>