More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37190 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37190  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  100 
 
 
328 aa  631  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0860  Asparaginase/glutaminase  50.77 
 
 
327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.832508  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0900  asparaginase/glutaminase  50.46 
 
 
327 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1946  asparaginase/glutaminase  47.89 
 
 
352 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0515464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0827  Asparaginase/glutaminase  50.33 
 
 
327 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3001  asparaginase/glutaminase  46.93 
 
 
350 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2741  asparaginase  43.77 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3220  asparaginase/glutaminase  47.55 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1178  asparaginase/glutaminase  40.8 
 
 
329 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228392  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1194  asparaginase/glutaminase  42.95 
 
 
329 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1009  L-asparaginase II  34.43 
 
 
325 aa  186  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0200439  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1160  asparaginase/glutaminase  43.67 
 
 
329 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511952  normal  0.0114275 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1888  asparaginase family protein  41.53 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000189998  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1262  putative L-asparaginase  36.25 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2981  Asparaginase  40.88 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1709  anthranilate synthase component II  33.84 
 
 
325 aa  181  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0192  Asparaginase/glutaminase  41.98 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1962  asparaginase family protein  40.86 
 
 
329 aa  179  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4252  asparaginase/glutaminase  40.38 
 
 
329 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  33.64 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  33.86 
 
 
327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  32.73 
 
 
338 aa  162  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  34.03 
 
 
327 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  34.15 
 
 
334 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  33.23 
 
 
327 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1046  L-asparaginase  32.21 
 
 
322 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2187  asparaginase/glutaminase  36.94 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560936  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1837  asparaginase/glutaminase  35.8 
 
 
321 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  39.88 
 
 
330 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  39.09 
 
 
340 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  37.08 
 
 
355 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1297  asparaginase/glutaminase  37.26 
 
 
320 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  39.16 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0094  asparaginase/glutaminase  39.02 
 
 
321 aa  145  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.875352  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1679  asparaginase family protein  32.2 
 
 
320 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0304633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  31.9 
 
 
324 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  31.9 
 
 
324 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  38.48 
 
 
340 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1535  asparaginase/glutaminase  31.56 
 
 
322 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1566  asparaginase/glutaminase  31.56 
 
 
322 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  39.02 
 
 
340 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4951  L-asparaginase, type II  40.23 
 
 
323 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  31.9 
 
 
324 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  37.74 
 
 
346 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  31.9 
 
 
324 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  31.9 
 
 
324 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  31.9 
 
 
324 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0779  L-asparaginase  32.81 
 
 
322 aa  140  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  30.98 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  35.68 
 
 
354 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  34.77 
 
 
338 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  36.92 
 
 
345 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  37.74 
 
 
338 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  38.11 
 
 
365 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  38.11 
 
 
365 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  37.8 
 
 
340 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  36.92 
 
 
345 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  36.54 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1590  L-asparaginase  32.86 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36341e-23 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  35.97 
 
 
348 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  35.81 
 
 
332 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  35.97 
 
 
348 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0782  asparaginase  33.64 
 
 
320 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  35.97 
 
 
348 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  35.97 
 
 
348 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  41.63 
 
 
347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1551  L-asparaginase  32.86 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000310324  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  35.97 
 
 
348 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  35.81 
 
 
332 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  34.04 
 
 
348 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  38.44 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  38.44 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  38.44 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  38.44 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  38.44 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  38.44 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  32.62 
 
 
349 aa  132  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  32.96 
 
 
348 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1690  L-asparaginase  32.48 
 
 
307 aa  132  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.758697  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03600  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  39.87 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  42.45 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3794  L-asparaginase  32.86 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538157  hitchhiker  0.000000163476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  33.71 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.881329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  33.93 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  35.29 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  33.93 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  33.71 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1812  L-asparaginase, type II  36.55 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0266176  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  33.71 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  33.71 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  33.71 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  33.71 
 
 
348 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  34.77 
 
 
328 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  31.34 
 
 
348 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  34.51 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  29.69 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1657  L-asparaginase  32.5 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000496167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1583  asparaginase  35.48 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000246256  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  31.23 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22840  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  39.85 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>