266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1962 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1888  asparaginase family protein  99.09 
 
 
329 aa  661    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000189998  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1962  asparaginase family protein  100 
 
 
329 aa  670    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255532  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1262  putative L-asparaginase  49.07 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1009  L-asparaginase II  48.91 
 
 
325 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0200439  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1709  anthranilate synthase component II  48 
 
 
325 aa  281  1e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1194  asparaginase/glutaminase  46.67 
 
 
329 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1160  asparaginase/glutaminase  47.3 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511952  normal  0.0114275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1178  asparaginase/glutaminase  44.48 
 
 
329 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228392  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4252  asparaginase/glutaminase  47.48 
 
 
329 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1946  asparaginase/glutaminase  45.05 
 
 
352 aa  235  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0515464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2741  asparaginase  44.34 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3220  asparaginase/glutaminase  42.99 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3001  asparaginase/glutaminase  43.3 
 
 
350 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2981  Asparaginase  42.54 
 
 
327 aa  208  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0860  Asparaginase/glutaminase  42.72 
 
 
327 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.832508  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0900  asparaginase/glutaminase  43.04 
 
 
327 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37190  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  41.27 
 
 
328 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0827  Asparaginase/glutaminase  42.03 
 
 
327 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  36.22 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0192  Asparaginase/glutaminase  38.73 
 
 
328 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  35.74 
 
 
349 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  36.45 
 
 
334 aa  179  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  34.97 
 
 
348 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  34 
 
 
348 aa  169  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  34.1 
 
 
348 aa  168  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  36.75 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  36.75 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  36.5 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  32.11 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  31.8 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0782  asparaginase  35.05 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  36.42 
 
 
345 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0779  L-asparaginase  35.19 
 
 
322 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  35.91 
 
 
338 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1679  asparaginase family protein  33.97 
 
 
320 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0304633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  34.49 
 
 
348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  33.91 
 
 
331 aa  156  6e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1566  asparaginase/glutaminase  32.29 
 
 
322 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  33.92 
 
 
352 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  34.81 
 
 
355 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1535  asparaginase/glutaminase  32.29 
 
 
322 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  34.65 
 
 
327 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  35.1 
 
 
348 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  35.1 
 
 
348 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  35.1 
 
 
348 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  35.1 
 
 
348 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  35.33 
 
 
352 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  35.1 
 
 
348 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  34.44 
 
 
348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.881329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  34.12 
 
 
355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  35.31 
 
 
356 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  34.44 
 
 
348 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  34.44 
 
 
348 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  34.44 
 
 
348 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  34.44 
 
 
348 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  34.44 
 
 
348 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  34.44 
 
 
348 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  35 
 
 
352 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  32.73 
 
 
324 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  32.73 
 
 
324 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  35 
 
 
352 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  34.12 
 
 
355 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  34.44 
 
 
348 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  34.44 
 
 
348 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  34.44 
 
 
348 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1046  L-asparaginase  30.52 
 
 
322 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101218  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  34.38 
 
 
328 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1690  L-asparaginase  33.69 
 
 
307 aa  151  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.758697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  32.73 
 
 
324 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  32.11 
 
 
324 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  33.66 
 
 
354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  32.52 
 
 
324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  32.52 
 
 
324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  32.52 
 
 
324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  35.69 
 
 
348 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1590  L-asparaginase  32.14 
 
 
310 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36341e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1551  L-asparaginase  32.9 
 
 
310 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000310324  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2021  Asparaginase/glutaminase  32.52 
 
 
362 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3794  L-asparaginase  31.8 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538157  hitchhiker  0.000000163476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  33.89 
 
 
349 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  33.53 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2272  Asparaginase/glutaminase  35.28 
 
 
367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1657  L-asparaginase  31.92 
 
 
310 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000496167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  35.54 
 
 
367 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  33.04 
 
 
344 aa  138  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  33.86 
 
 
338 aa  138  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03600  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  38.64 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1837  asparaginase/glutaminase  34.18 
 
 
321 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368695  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  35.59 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  33.23 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2449  asparaginase  33.22 
 
 
327 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39982  predicted protein  31.3 
 
 
398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0447  Asparaginase/glutaminase  32.79 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  34.98 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  34.23 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  33.63 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  30.13 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3136  L-asparaginase, type II  32.07 
 
 
373 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3863  L-asparaginases, type II  32.07 
 
 
366 aa  126  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.354581 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4951  L-asparaginase, type II  32.31 
 
 
323 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>