258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1160 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1160  asparaginase/glutaminase  100 
 
 		 329 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511952  normal  0.0114275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1194  asparaginase/glutaminase  95.44 
 
 		 329 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4252  asparaginase/glutaminase  86.85 
 
 		 329 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1178  asparaginase/glutaminase  74.31 
 
 		 329 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228392  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1888  asparaginase family protein  48.16 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000189998  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1709  anthranilate synthase component II  41.53 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1009  L-asparaginase II  41.25 
 
 		 325 aa  255  9e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0200439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1962  asparaginase family protein  47.83 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255532  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1262  putative L-asparaginase  41.75 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2741  asparaginase  43.71 
 
 		 329 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1946  asparaginase/glutaminase  45.22 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0515464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3001  asparaginase/glutaminase  44.77 
 
 		 350 aa  209  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37190  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  43.67 
 
 		 328 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3220  asparaginase/glutaminase  43.13 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0900  asparaginase/glutaminase  41.8 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0860  Asparaginase/glutaminase  41.8 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.832508  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  34.15 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0827  Asparaginase/glutaminase  41.72 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  35.83 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0192  Asparaginase/glutaminase  37.99 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2981  Asparaginase  38.49 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  30.77 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  36.34 
 
 		 355 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  34.24 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  35.67 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  30.79 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1837  asparaginase/glutaminase  34.69 
 
 		 321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368695  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0782  asparaginase  32.82 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  29.97 
 
 		 327 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  29.65 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  31.94 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1046  L-asparaginase  28.66 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03600  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  40.92 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  31.97 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  31.97 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2187  asparaginase/glutaminase  34.06 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  30 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  31.66 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  32.45 
 
 		 354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1590  L-asparaginase  32.98 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36341e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3794  L-asparaginase  33.33 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538157  hitchhiker  0.000000163476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1551  L-asparaginase  32.98 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000310324  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  31.94 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  32.45 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  34.9 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  34.9 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  30.19 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  31.97 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  31.97 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  31.97 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1297  asparaginase/glutaminase  33.96 
 
 		 320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  30.31 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  34.9 
 
 		 345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  32.27 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  32.27 
 
 		 356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  32.27 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  32.27 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  30.21 
 
 		 348 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  32.77 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  33.13 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  30.12 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  30.56 
 
 		 347 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  32.31 
 
 		 354 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  32.43 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  32.43 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  32.43 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  32.43 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  32.43 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  32.43 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881329 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1657  L-asparaginase  32.62 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000496167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  32.09 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1679  asparaginase family protein  29.75 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0304633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1566  asparaginase/glutaminase  28.27 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  32.09 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  32.43 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  34.13 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1535  asparaginase/glutaminase  28.27 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  29.55 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  35.35 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  29.34 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  32.51 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  32.51 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  32.51 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2449  asparaginase  34.25 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  32.51 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  32.51 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  34.93 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0779  L-asparaginase  30.89 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  30.09 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2132  asparaginase  35.67 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  28.1 
 
 		 349 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  28.27 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1690  L-asparaginase  29.79 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.758697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  34.04 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  32.15 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  33.54 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2272  Asparaginase/glutaminase  31.49 
 
 		 367 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.120456 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00300  asparaginase, aspartic hydroxamate res. (Eurofung)  30.37 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0205708  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2021  Asparaginase/glutaminase  29.08 
 
 		 362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  33.64 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>